Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ3

DNAJC4, DnaJ homolog subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC4Q9NNZ3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAJC4Q9NNZ3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAJC4Q9NNZ3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAJC4Q9NNZ3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAJC4Q9NNZ3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAJC4Q9NNZ3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAJC4Q9NNZ3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAJC4Q9NNZ3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNAJC4Q9NNZ3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DNAJC4Q9NNZ3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DNAJC4Q9NNZ3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DNAJC4Q9NNZ3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DNAJC4Q9NNZ3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DNAJC4Q9NNZ3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DNAJC4Q9NNZ3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DNAJC4Q9NNZ3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DNAJC4Q9NNZ3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DNAJC4Q9NNZ3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DNAJC4Q9NNZ3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DNAJC4Q9NNZ3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DNAJC4Q9NNZ3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAJC4Q9NNZ3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAJC4Q9NNZ3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAJC4Q9NNZ3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAJC4Q9NNZ3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAJC4Q9NNZ3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAJC4Q9NNZ3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAJC4Q9NNZ3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAJC4Q9NNZ3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAJC4Q9NNZ3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DNAJC4Q9NNZ3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DNAJC4Q9NNZ3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAJC4Q9NNZ3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAJC4Q9NNZ3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DNAJC4Q9NNZ3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DNAJC4Q9NNZ3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAJC4Q9NNZ3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAJC4Q9NNZ3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAJC4Q9NNZ3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAJC4Q9NNZ3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAJC4Q9NNZ3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAJC4Q9NNZ3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DNAJC4Q9NNZ3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DNAJC4Q9NNZ3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DNAJC4Q9NNZ3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DNAJC4Q9NNZ3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNAJC4Q9NNZ3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNAJC4Q9NNZ3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DNAJC4Q9NNZ3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DNAJC4Q9NNZ3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DNAJC4Q9NNZ3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DNAJC4Q9NNZ3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DNAJC4Q9NNZ3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DNAJC4Q9NNZ3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DNAJC4Q9NNZ3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DNAJC4Q9NNZ3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DNAJC4Q9NNZ3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DNAJC4Q9NNZ3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DNAJC4Q9NNZ3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DNAJC4Q9NNZ3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DNAJC4Q9NNZ3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DNAJC4Q9NNZ3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DNAJC4Q9NNZ3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DNAJC4Q9NNZ3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DNAJC4Q9NNZ3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DNAJC4Q9NNZ3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DNAJC4Q9NNZ3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DNAJC4Q9NNZ3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DNAJC4Q9NNZ3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DNAJC4Q9NNZ3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DNAJC4Q9NNZ3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
DNAJC4Q9NNZ3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DNAJC4Q9NNZ3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DNAJC4Q9NNZ3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DNAJC4Q9NNZ3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DNAJC4Q9NNZ3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DNAJC4Q9NNZ3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DNAJC4Q9NNZ3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
DNAJC4Q9NNZ3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DNAJC4Q9NNZ3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DNAJC4Q9NNZ3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DNAJC4Q9NNZ3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
DNAJC4Q9NNZ3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DNAJC4Q9NNZ3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DNAJC4Q9NNZ3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DNAJC4Q9NNZ3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DNAJC4Q9NNZ3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DNAJC4Q9NNZ3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DNAJC4Q9NNZ3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DNAJC4Q9NNZ3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DNAJC4Q9NNZ3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DNAJC4Q9NNZ3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DNAJC4Q9NNZ3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
DNAJC4Q9NNZ3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DNAJC4Q9NNZ3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
DNAJC4Q9NNZ3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DNAJC4Q9NNZ3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms