Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TUFT1Q9NNX1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
TUFT1Q9NNX1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TUFT1Q9NNX1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TUFT1Q9NNX1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TUFT1Q9NNX1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TUFT1Q9NNX1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TUFT1Q9NNX1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TUFT1Q9NNX1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TUFT1Q9NNX1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TUFT1Q9NNX1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TUFT1Q9NNX1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TUFT1Q9NNX1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TUFT1Q9NNX1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TUFT1Q9NNX1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TUFT1Q9NNX1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TUFT1Q9NNX1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TUFT1Q9NNX1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
TUFT1Q9NNX1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TUFT1Q9NNX1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TUFT1Q9NNX1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TUFT1Q9NNX1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TUFT1Q9NNX1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TUFT1Q9NNX1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TUFT1Q9NNX1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TUFT1Q9NNX1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TUFT1Q9NNX1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TUFT1Q9NNX1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TUFT1Q9NNX1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TUFT1Q9NNX1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TUFT1Q9NNX1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TUFT1Q9NNX1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TUFT1Q9NNX1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TUFT1Q9NNX1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TUFT1Q9NNX1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TUFT1Q9NNX1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TUFT1Q9NNX1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TUFT1Q9NNX1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TUFT1Q9NNX1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TUFT1Q9NNX1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TUFT1Q9NNX1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TUFT1Q9NNX1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TUFT1Q9NNX1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TUFT1Q9NNX1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TUFT1Q9NNX1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TUFT1Q9NNX1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TUFT1Q9NNX1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TUFT1Q9NNX1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TUFT1Q9NNX1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TUFT1Q9NNX1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TUFT1Q9NNX1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TUFT1Q9NNX1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TUFT1Q9NNX1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TUFT1Q9NNX1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TUFT1Q9NNX1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TUFT1Q9NNX1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TUFT1Q9NNX1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TUFT1Q9NNX1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TUFT1Q9NNX1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TUFT1Q9NNX1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TUFT1Q9NNX1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TUFT1Q9NNX1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TUFT1Q9NNX1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TUFT1Q9NNX1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
TUFT1Q9NNX1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TUFT1Q9NNX1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TUFT1Q9NNX1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TUFT1Q9NNX1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TUFT1Q9NNX1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TUFT1Q9NNX1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TUFT1Q9NNX1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TUFT1Q9NNX1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
TUFT1Q9NNX1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TUFT1Q9NNX1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TUFT1Q9NNX1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TUFT1Q9NNX1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30■■■□□ 2.39
TUFT1Q9NNX1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TUFT1Q9NNX1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TUFT1Q9NNX1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TUFT1Q9NNX1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TUFT1Q9NNX1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TUFT1Q9NNX1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TUFT1Q9NNX1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TUFT1Q9NNX1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TUFT1Q9NNX1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TUFT1Q9NNX1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TUFT1Q9NNX1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TUFT1Q9NNX1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TUFT1Q9NNX1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TUFT1Q9NNX1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TUFT1Q9NNX1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TUFT1Q9NNX1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TUFT1Q9NNX1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TUFT1Q9NNX1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TUFT1Q9NNX1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TUFT1Q9NNX1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TUFT1Q9NNX1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TUFT1Q9NNX1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TUFT1Q9NNX1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TUFT1Q9NNX1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.6 ms