Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8W5

TRIM45, Tripartite motif-containing protein 45, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM45Q9H8W5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM45Q9H8W5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM45Q9H8W5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM45Q9H8W5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM45Q9H8W5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM45Q9H8W5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM45Q9H8W5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM45Q9H8W5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM45Q9H8W5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM45Q9H8W5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM45Q9H8W5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM45Q9H8W5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM45Q9H8W5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM45Q9H8W5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM45Q9H8W5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRIM45Q9H8W5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM45Q9H8W5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM45Q9H8W5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM45Q9H8W5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM45Q9H8W5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM45Q9H8W5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM45Q9H8W5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM45Q9H8W5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM45Q9H8W5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM45Q9H8W5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM45Q9H8W5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM45Q9H8W5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM45Q9H8W5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM45Q9H8W5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM45Q9H8W5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM45Q9H8W5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM45Q9H8W5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM45Q9H8W5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM45Q9H8W5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM45Q9H8W5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM45Q9H8W5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM45Q9H8W5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM45Q9H8W5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM45Q9H8W5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM45Q9H8W5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM45Q9H8W5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRIM45Q9H8W5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM45Q9H8W5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM45Q9H8W5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM45Q9H8W5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM45Q9H8W5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM45Q9H8W5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM45Q9H8W5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM45Q9H8W5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM45Q9H8W5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM45Q9H8W5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM45Q9H8W5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM45Q9H8W5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM45Q9H8W5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM45Q9H8W5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM45Q9H8W5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM45Q9H8W5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM45Q9H8W5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM45Q9H8W5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM45Q9H8W5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM45Q9H8W5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM45Q9H8W5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM45Q9H8W5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM45Q9H8W5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM45Q9H8W5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM45Q9H8W5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM45Q9H8W5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM45Q9H8W5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM45Q9H8W5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM45Q9H8W5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM45Q9H8W5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM45Q9H8W5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM45Q9H8W5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM45Q9H8W5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM45Q9H8W5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM45Q9H8W5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM45Q9H8W5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM45Q9H8W5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM45Q9H8W5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM45Q9H8W5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM45Q9H8W5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM45Q9H8W5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM45Q9H8W5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM45Q9H8W5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM45Q9H8W5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM45Q9H8W5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM45Q9H8W5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM45Q9H8W5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM45Q9H8W5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM45Q9H8W5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM45Q9H8W5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM45Q9H8W5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM45Q9H8W5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM45Q9H8W5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM45Q9H8W5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM45Q9H8W5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM45Q9H8W5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM45Q9H8W5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM45Q9H8W5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM45Q9H8W5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms