Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
BCAS3Q9H6U6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
BCAS3Q9H6U6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
BCAS3Q9H6U6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
BCAS3Q9H6U6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
BCAS3Q9H6U6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
BCAS3Q9H6U6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
BCAS3Q9H6U6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
BCAS3Q9H6U6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
BCAS3Q9H6U6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
BCAS3Q9H6U6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
BCAS3Q9H6U6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
BCAS3Q9H6U6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
BCAS3Q9H6U6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
BCAS3Q9H6U6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
BCAS3Q9H6U6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
BCAS3Q9H6U6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
BCAS3Q9H6U6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
BCAS3Q9H6U6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
BCAS3Q9H6U6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
BCAS3Q9H6U6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
BCAS3Q9H6U6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
BCAS3Q9H6U6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
BCAS3Q9H6U6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
BCAS3Q9H6U6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
BCAS3Q9H6U6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
BCAS3Q9H6U6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
BCAS3Q9H6U6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
BCAS3Q9H6U6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
BCAS3Q9H6U6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
BCAS3Q9H6U6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
BCAS3Q9H6U6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
BCAS3Q9H6U6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
BCAS3Q9H6U6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
BCAS3Q9H6U6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
BCAS3Q9H6U6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
BCAS3Q9H6U6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
BCAS3Q9H6U6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
BCAS3Q9H6U6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
BCAS3Q9H6U6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
BCAS3Q9H6U6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
BCAS3Q9H6U6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
BCAS3Q9H6U6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
BCAS3Q9H6U6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
BCAS3Q9H6U6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
BCAS3Q9H6U6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
BCAS3Q9H6U6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
BCAS3Q9H6U6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
BCAS3Q9H6U6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
BCAS3Q9H6U6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
BCAS3Q9H6U6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
BCAS3Q9H6U6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
BCAS3Q9H6U6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
BCAS3Q9H6U6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
BCAS3Q9H6U6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
BCAS3Q9H6U6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
BCAS3Q9H6U6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
BCAS3Q9H6U6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
BCAS3Q9H6U6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
BCAS3Q9H6U6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
BCAS3Q9H6U6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
BCAS3Q9H6U6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
BCAS3Q9H6U6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
BCAS3Q9H6U6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
BCAS3Q9H6U6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
BCAS3Q9H6U6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
BCAS3Q9H6U6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
BCAS3Q9H6U6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
BCAS3Q9H6U6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
BCAS3Q9H6U6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
BCAS3Q9H6U6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
BCAS3Q9H6U6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
BCAS3Q9H6U6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
BCAS3Q9H6U6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
BCAS3Q9H6U6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
BCAS3Q9H6U6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
BCAS3Q9H6U6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
BCAS3Q9H6U6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
BCAS3Q9H6U6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
BCAS3Q9H6U6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
BCAS3Q9H6U6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
BCAS3Q9H6U6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
BCAS3Q9H6U6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
BCAS3Q9H6U6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
BCAS3Q9H6U6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
BCAS3Q9H6U6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
BCAS3Q9H6U6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
BCAS3Q9H6U6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
BCAS3Q9H6U6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
BCAS3Q9H6U6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
BCAS3Q9H6U6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
BCAS3Q9H6U6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
BCAS3Q9H6U6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
BCAS3Q9H6U6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
BCAS3Q9H6U6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
BCAS3Q9H6U6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
BCAS3Q9H6U6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
BCAS3Q9H6U6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
BCAS3Q9H6U6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
BCAS3Q9H6U6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.7 ms