Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2M9

RAB3GAP2, Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP2Q9H2M9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
RAB3GAP2Q9H2M9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
RAB3GAP2Q9H2M9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
RAB3GAP2Q9H2M9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
RAB3GAP2Q9H2M9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
RAB3GAP2Q9H2M9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
RAB3GAP2Q9H2M9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
RAB3GAP2Q9H2M9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
RAB3GAP2Q9H2M9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
RAB3GAP2Q9H2M9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
RAB3GAP2Q9H2M9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
RAB3GAP2Q9H2M9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC40.54■■■■■ 4.08
RAB3GAP2Q9H2M9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.54■■■■■ 4.08
RAB3GAP2Q9H2M9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
RAB3GAP2Q9H2M9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC40.53■■■■■ 4.08
RAB3GAP2Q9H2M9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC40.53■■■■■ 4.08
RAB3GAP2Q9H2M9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
RAB3GAP2Q9H2M9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
RAB3GAP2Q9H2M9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.07
RAB3GAP2Q9H2M9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
RAB3GAP2Q9H2M9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
RAB3GAP2Q9H2M9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
RAB3GAP2Q9H2M9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
RAB3GAP2Q9H2M9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
RAB3GAP2Q9H2M9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
RAB3GAP2Q9H2M9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
RAB3GAP2Q9H2M9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
RAB3GAP2Q9H2M9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
RAB3GAP2Q9H2M9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC40.41■■■■■ 4.06
RAB3GAP2Q9H2M9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
RAB3GAP2Q9H2M9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
RAB3GAP2Q9H2M9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
RAB3GAP2Q9H2M9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
RAB3GAP2Q9H2M9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
RAB3GAP2Q9H2M9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
RAB3GAP2Q9H2M9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
RAB3GAP2Q9H2M9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
RAB3GAP2Q9H2M9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
RAB3GAP2Q9H2M9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC40.32■■■■■ 4.04
RAB3GAP2Q9H2M9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
RAB3GAP2Q9H2M9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
RAB3GAP2Q9H2M9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
RAB3GAP2Q9H2M9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
RAB3GAP2Q9H2M9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
RAB3GAP2Q9H2M9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
RAB3GAP2Q9H2M9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
RAB3GAP2Q9H2M9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
RAB3GAP2Q9H2M9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
RAB3GAP2Q9H2M9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
RAB3GAP2Q9H2M9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
RAB3GAP2Q9H2M9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
RAB3GAP2Q9H2M9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
RAB3GAP2Q9H2M9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
RAB3GAP2Q9H2M9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
RAB3GAP2Q9H2M9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
RAB3GAP2Q9H2M9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
RAB3GAP2Q9H2M9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
RAB3GAP2Q9H2M9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
RAB3GAP2Q9H2M9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
RAB3GAP2Q9H2M9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC40.1■■■■■ 4.01
RAB3GAP2Q9H2M9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
RAB3GAP2Q9H2M9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
RAB3GAP2Q9H2M9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
RAB3GAP2Q9H2M9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
RAB3GAP2Q9H2M9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
RAB3GAP2Q9H2M9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC40.07■■■■■ 4.01
RAB3GAP2Q9H2M9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
RAB3GAP2Q9H2M9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
RAB3GAP2Q9H2M9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
RAB3GAP2Q9H2M9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
RAB3GAP2Q9H2M9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
RAB3GAP2Q9H2M9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
RAB3GAP2Q9H2M9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
RAB3GAP2Q9H2M9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
RAB3GAP2Q9H2M9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
RAB3GAP2Q9H2M9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
RAB3GAP2Q9H2M9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
RAB3GAP2Q9H2M9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
RAB3GAP2Q9H2M9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
RAB3GAP2Q9H2M9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
RAB3GAP2Q9H2M9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
RAB3GAP2Q9H2M9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
RAB3GAP2Q9H2M9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
RAB3GAP2Q9H2M9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
RAB3GAP2Q9H2M9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
RAB3GAP2Q9H2M9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC39.96■■■■□ 3.99
RAB3GAP2Q9H2M9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
RAB3GAP2Q9H2M9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
RAB3GAP2Q9H2M9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
RAB3GAP2Q9H2M9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
RAB3GAP2Q9H2M9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
RAB3GAP2Q9H2M9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
RAB3GAP2Q9H2M9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
RAB3GAP2Q9H2M9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
RAB3GAP2Q9H2M9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
RAB3GAP2Q9H2M9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
RAB3GAP2Q9H2M9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
RAB3GAP2Q9H2M9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
RAB3GAP2Q9H2M9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
RAB3GAP2Q9H2M9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms