Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2K0

MTIF3, Translation initiation factor IF-3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTIF3Q9H2K0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
MTIF3Q9H2K0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MTIF3Q9H2K0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MTIF3Q9H2K0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
MTIF3Q9H2K0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MTIF3Q9H2K0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MTIF3Q9H2K0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MTIF3Q9H2K0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
MTIF3Q9H2K0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MTIF3Q9H2K0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MTIF3Q9H2K0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MTIF3Q9H2K0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
MTIF3Q9H2K0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
MTIF3Q9H2K0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MTIF3Q9H2K0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
MTIF3Q9H2K0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MTIF3Q9H2K0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MTIF3Q9H2K0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
MTIF3Q9H2K0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
MTIF3Q9H2K0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MTIF3Q9H2K0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
MTIF3Q9H2K0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MTIF3Q9H2K0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
MTIF3Q9H2K0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
MTIF3Q9H2K0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MTIF3Q9H2K0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
MTIF3Q9H2K0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MTIF3Q9H2K0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MTIF3Q9H2K0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
MTIF3Q9H2K0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MTIF3Q9H2K0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MTIF3Q9H2K0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MTIF3Q9H2K0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MTIF3Q9H2K0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MTIF3Q9H2K0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MTIF3Q9H2K0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MTIF3Q9H2K0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MTIF3Q9H2K0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MTIF3Q9H2K0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MTIF3Q9H2K0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MTIF3Q9H2K0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MTIF3Q9H2K0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
MTIF3Q9H2K0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MTIF3Q9H2K0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MTIF3Q9H2K0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MTIF3Q9H2K0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MTIF3Q9H2K0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
MTIF3Q9H2K0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MTIF3Q9H2K0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
MTIF3Q9H2K0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
MTIF3Q9H2K0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
MTIF3Q9H2K0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
MTIF3Q9H2K0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MTIF3Q9H2K0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MTIF3Q9H2K0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
MTIF3Q9H2K0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
MTIF3Q9H2K0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
MTIF3Q9H2K0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
MTIF3Q9H2K0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
MTIF3Q9H2K0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MTIF3Q9H2K0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
MTIF3Q9H2K0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
MTIF3Q9H2K0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MTIF3Q9H2K0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MTIF3Q9H2K0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MTIF3Q9H2K0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MTIF3Q9H2K0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MTIF3Q9H2K0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MTIF3Q9H2K0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MTIF3Q9H2K0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MTIF3Q9H2K0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
MTIF3Q9H2K0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
MTIF3Q9H2K0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MTIF3Q9H2K0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MTIF3Q9H2K0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MTIF3Q9H2K0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MTIF3Q9H2K0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MTIF3Q9H2K0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MTIF3Q9H2K0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MTIF3Q9H2K0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MTIF3Q9H2K0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MTIF3Q9H2K0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MTIF3Q9H2K0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MTIF3Q9H2K0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MTIF3Q9H2K0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
MTIF3Q9H2K0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MTIF3Q9H2K0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
MTIF3Q9H2K0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
MTIF3Q9H2K0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
MTIF3Q9H2K0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MTIF3Q9H2K0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MTIF3Q9H2K0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MTIF3Q9H2K0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MTIF3Q9H2K0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MTIF3Q9H2K0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MTIF3Q9H2K0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MTIF3Q9H2K0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
MTIF3Q9H2K0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MTIF3Q9H2K0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MTIF3Q9H2K0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms