Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0L4

CSTF2T, Cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF2TQ9H0L4 UBE2V1-206ENST00000415862 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.842e-9■■■■■ 39.6
CSTF2TQ9H0L4 UBE2V1-216ENST00000483534 1155 ntTSL 1 (best)9.69□□□□□ -0.862e-9■■■■■ 39.6
CSTF2TQ9H0L4 UBE2V1-211ENST00000467839 566 ntTSL 29.69□□□□□ -0.862e-9■■■■■ 39.6
CSTF2TQ9H0L4 UBE2V1-223ENST00000617119 2432 ntTSL 4 BASIC8.4□□□□□ -1.062e-9■■■■■ 39.6
CSTF2TQ9H0L4 UBE2V1-205ENST00000396059 1983 ntTSL 1 (best)8.21□□□□□ -1.092e-9■■■■■ 39.6
CSTF2TQ9H0L4 UBE2V1-204ENST00000371677 2459 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.132e-9■■■■■ 39.6
CSTF2TQ9H0L4 UBE2V1-219ENST00000490555 549 ntTSL 47.41□□□□□ -1.222e-9■■■■■ 39.6
CSTF2TQ9H0L4 UBE2V1-201ENST00000340309 2536 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.252e-9■■■■■ 39.6
CSTF2TQ9H0L4 UBE2V1-202ENST00000371657 1973 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.282e-9■■■■■ 39.6
CSTF2TQ9H0L4 UBE2V1-221ENST00000493090 563 ntTSL 46.92□□□□□ -1.32e-9■■■■■ 39.6
CSTF2TQ9H0L4 UBE2V1-220ENST00000492371 535 ntTSL 36.92□□□□□ -1.32e-9■■■■■ 39.6
CSTF2TQ9H0L4 UBE2V1-208ENST00000432266 569 ntTSL 45.63□□□□□ -1.512e-9■■■■■ 39.6
CSTF2TQ9H0L4 UBE2V1-214ENST00000472923 421 ntTSL 54.86□□□□□ -1.632e-9■■■■■ 39.6
CSTF2TQ9H0L4 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.447e-10■■■■■ 39.5
CSTF2TQ9H0L4 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.326e-7■■■■■ 39.2
CSTF2TQ9H0L4 PRIMPOL-201ENST00000314970 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.536e-7■■■■■ 39.2
CSTF2TQ9H0L4 PRIMPOL-209ENST00000512834 2174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.636e-7■■■■■ 39.2
CSTF2TQ9H0L4 PRIMPOL-205ENST00000509002 1631 ntTSL 1 (best)10.01□□□□□ -0.816e-7■■■■■ 39.2
CSTF2TQ9H0L4 PRIMPOL-202ENST00000503752 2168 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.866e-7■■■■■ 39.2
CSTF2TQ9H0L4 PRIMPOL-203ENST00000506278 1138 ntTSL 1 (best)7.44□□□□□ -1.226e-7■■■■■ 39.2
CSTF2TQ9H0L4 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.063e-7■■■■■ 39.2
CSTF2TQ9H0L4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.251e-11■■■■■ 39.2
CSTF2TQ9H0L4 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC13□□□□□ -0.331e-11■■■■■ 39.2
CSTF2TQ9H0L4 R3HDM4-202ENST00000586080 537 ntTSL 420.31■□□□□ 0.842e-9■■■■■ 39.1
CSTF2TQ9H0L4 R3HDM4-207ENST00000591829 823 ntTSL 512.81□□□□□ -0.362e-9■■■■■ 39.1
CSTF2TQ9H0L4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.187e-14■■■■■ 39.1
CSTF2TQ9H0L4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.233e-7■■■■■ 39.1
CSTF2TQ9H0L4 CLTCL1-207ENST00000611723 838 ntTSL 214.54□□□□□ -0.082e-7■■■■■ 39
CSTF2TQ9H0L4 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.352e-7■■■■■ 39
CSTF2TQ9H0L4 CLTCL1-210ENST00000617926 1695 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.482e-7■■■■■ 39
CSTF2TQ9H0L4 CLTCL1-209ENST00000617103 4859 ntTSL 1 (best)10.24□□□□□ -0.772e-7■■■■■ 39
CSTF2TQ9H0L4 CLTCL1-202ENST00000427926 5513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.822e-7■■■■■ 39
CSTF2TQ9H0L4 CLTCL1-211ENST00000621271 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.862e-7■■■■■ 39
CSTF2TQ9H0L4 CLTCL1-208ENST00000615606 4994 ntTSL 1 (best)9.06□□□□□ -0.962e-7■■■■■ 39
CSTF2TQ9H0L4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -05e-10■■■■■ 38.9
CSTF2TQ9H0L4 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.285e-13■■■■■ 38.9
CSTF2TQ9H0L4 PRAME-209ENST00000439106 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 313.01□□□□□ -0.335e-13■■■■■ 38.9
CSTF2TQ9H0L4 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.395e-13■■■■■ 38.9
CSTF2TQ9H0L4 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.435e-13■■■■■ 38.9
CSTF2TQ9H0L4 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.465e-13■■■■■ 38.9
CSTF2TQ9H0L4 PRAME-207ENST00000420709 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 212.19□□□□□ -0.465e-13■■■■■ 38.9
CSTF2TQ9H0L4 PRAME-201ENST00000398741 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.475e-13■■■■■ 38.9
CSTF2TQ9H0L4 PRAME-203ENST00000402697 2057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.485e-13■■■■■ 38.9
CSTF2TQ9H0L4 PRAME-213ENST00000492657 2831 ntTSL 1 (best)11.73□□□□□ -0.535e-13■■■■■ 38.9
CSTF2TQ9H0L4 ANKRD10-211ENST00000603993 704 ntTSL 210.02□□□□□ -0.819e-9■■■■■ 38.9
CSTF2TQ9H0L4 ANKRD10-209ENST00000489973 745 ntTSL 38.33□□□□□ -1.089e-9■■■■■ 38.9
CSTF2TQ9H0L4 ANKRD10-208ENST00000485844 641 ntTSL 27.5□□□□□ -1.219e-9■■■■■ 38.9
CSTF2TQ9H0L4 CDYL-208ENST00000483019 773 ntTSL 29.18□□□□□ -0.941e-20■■■■■ 38.6
CSTF2TQ9H0L4 CDYL-204ENST00000440139 690 ntTSL 37.93□□□□□ -1.141e-20■■■■■ 38.6
CSTF2TQ9H0L4 CDYL-209ENST00000491864 614 ntTSL 56.34□□□□□ -1.391e-20■■■■■ 38.6
CSTF2TQ9H0L4 CAMTA1-209ENST00000476163 863 ntTSL 218.19■□□□□ 0.51e-6■■■■■ 38.6
CSTF2TQ9H0L4 SMC4-221ENST00000489573 1553 ntTSL 1 (best)19.53■□□□□ 0.727e-12■■■■■ 38.5
CSTF2TQ9H0L4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.377e-12■■■■■ 38.5
CSTF2TQ9H0L4 SMC4-209ENST00000468653 1756 ntTSL 217■□□□□ 0.317e-12■■■■■ 38.5
CSTF2TQ9H0L4 SMC4-211ENST00000469858 1971 ntTSL 216.18■□□□□ 0.187e-12■■■■■ 38.5
CSTF2TQ9H0L4 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.027e-12■■■■■ 38.5
CSTF2TQ9H0L4 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.427e-12■■■■■ 38.5
CSTF2TQ9H0L4 ZIM2-203ENST00000595671 2054 ntTSL 1 (best)11.53□□□□□ -0.567e-12■■■■■ 38.5
CSTF2TQ9H0L4 SMC4-210ENST00000469762 3998 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.867e-12■■■■■ 38.5
CSTF2TQ9H0L4 ZIM2-207ENST00000601070 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.887e-12■■■■■ 38.5
CSTF2TQ9H0L4 SMC4-213ENST00000472282 667 ntTSL 38.49□□□□□ -1.057e-12■■■■■ 38.5
CSTF2TQ9H0L4 ZIM2-205ENST00000597281 2037 ntTSL 1 (best)8.41□□□□□ -1.067e-12■■■■■ 38.5
CSTF2TQ9H0L4 SMC4-214ENST00000472991 582 ntTSL 58.39□□□□□ -1.077e-12■■■■■ 38.5
CSTF2TQ9H0L4 SMC4-219ENST00000487747 637 ntTSL 57.69□□□□□ -1.187e-12■■■■■ 38.5
CSTF2TQ9H0L4 SMC4-212ENST00000470240 724 ntTSL 37.33□□□□□ -1.247e-12■■■■■ 38.5
CSTF2TQ9H0L4 SMC4-227ENST00000497984 563 ntTSL 57.28□□□□□ -1.247e-12■■■■■ 38.5
CSTF2TQ9H0L4 SMC4-208ENST00000467468 566 ntTSL 46.35□□□□□ -1.397e-12■■■■■ 38.5
CSTF2TQ9H0L4 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC3.13□□□□□ -1.917e-12■■■■■ 38.5
CSTF2TQ9H0L4 TNNT1-216ENST00000593046 800 ntTSL 212.83□□□□□ -0.361e-9■■■■■ 38.5
CSTF2TQ9H0L4 TNNT1-213ENST00000589226 604 ntTSL 212.67□□□□□ -0.381e-9■■■■■ 38.5
CSTF2TQ9H0L4 TNNT1-210ENST00000588147 489 ntTSL 1 (best)12.48□□□□□ -0.411e-9■■■■■ 38.5
CSTF2TQ9H0L4 TNNT1-215ENST00000592920 583 ntTSL 512.34□□□□□ -0.431e-9■■■■■ 38.5
CSTF2TQ9H0L4 TNNT1-205ENST00000586282 327 ntTSL 55.69□□□□□ -1.51e-9■■■■■ 38.5
CSTF2TQ9H0L4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.255e-7■■■■■ 38.5
CSTF2TQ9H0L4 MED16-209ENST00000592943 1628 ntTSL 1 (best)16.14■□□□□ 0.173e-7■■■■■ 38.5
CSTF2TQ9H0L4 MED16-205ENST00000586017 1403 ntTSL 1 (best)13.84□□□□□ -0.193e-7■■■■■ 38.5
CSTF2TQ9H0L4 MED16-211ENST00000606828 599 ntTSL 1 (best)12.84□□□□□ -0.353e-7■■■■■ 38.5
CSTF2TQ9H0L4 NUMBL-208ENST00000599594 393 ntTSL 522.52■■□□□ 1.24e-7■■■■■ 38.4
CSTF2TQ9H0L4 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.041e-6■■■■■ 38.3
CSTF2TQ9H0L4 DCUN1D4-211ENST00000506673 548 ntTSL 423.66■■□□□ 1.385e-9■■■■■ 38.3
CSTF2TQ9H0L4 DCUN1D4-222ENST00000513800 949 ntTSL 223.66■■□□□ 1.385e-9■■■■■ 38.3
CSTF2TQ9H0L4 DCUN1D4-220ENST00000511675 643 ntTSL 223.66■■□□□ 1.385e-9■■■■■ 38.3
CSTF2TQ9H0L4 DCUN1D4-205ENST00000502930 548 ntTSL 422.95■■□□□ 1.265e-9■■■■■ 38.3
CSTF2TQ9H0L4 DCUN1D4-213ENST00000507741 1584 ntTSL 220.8■□□□□ 0.925e-9■■■■■ 38.3
CSTF2TQ9H0L4 DCUN1D4-206ENST00000504113 594 ntTSL 420.57■□□□□ 0.885e-9■■■■■ 38.3
CSTF2TQ9H0L4 DCUN1D4-216ENST00000509376 2293 ntTSL 218.99■□□□□ 0.635e-9■■■■■ 38.3
CSTF2TQ9H0L4 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.245e-9■■■■■ 38.3
CSTF2TQ9H0L4 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.325e-9■■■■■ 38.3
CSTF2TQ9H0L4 DCUN1D4-204ENST00000477560 4840 ntTSL 24.48□□□□□ -1.695e-9■■■■■ 38.3
CSTF2TQ9H0L4 TFRC-201ENST00000360110 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.037e-17■■■■■ 38.2
CSTF2TQ9H0L4 TFRC-203ENST00000420415 4814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.157e-17■■■■■ 38.2
CSTF2TQ9H0L4 NME4-210ENST00000468031 1861 ntTSL 216.95■□□□□ 0.35e-16■■■■■ 38.2
CSTF2TQ9H0L4 LINC00894-205ENST00000449111 3414 ntTSL 58.68□□□□□ -1.021e-7■■■■■ 38.2
CSTF2TQ9H0L4 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.183e-10■■■■■ 38.2
CSTF2TQ9H0L4 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.363e-10■■■■■ 38.2
CSTF2TQ9H0L4 NIPA1-203ENST00000557930 582 ntTSL 212.51□□□□□ -0.413e-10■■■■■ 38.2
CSTF2TQ9H0L4 NIPA1-205ENST00000560069 575 ntTSL 411.52□□□□□ -0.573e-10■■■■■ 38.2
CSTF2TQ9H0L4 NIPA1-204ENST00000559448 2799 ntTSL 29.96□□□□□ -0.813e-10■■■■■ 38.2
CSTF2TQ9H0L4 NIPA1-206ENST00000560105 375 ntTSL 29.36□□□□□ -0.913e-10■■■■■ 38.2
CSTF2TQ9H0L4 NIPA1-202ENST00000437912 7613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.13e-10■■■■■ 38.2
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