RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513800.5

DCUN1D4-222, Transcript of defective in cullin neddylation 1 domain containing 4, human

TSL 2

Gene DCUN1D4, Length 949 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DCUN1D4-222	ENST00000513800	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		61.69	■■■■■ 7.47
DCUN1D4-222	ENST00000513800	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		55.09	■■■■■ 6.41
DCUN1D4-222	ENST00000513800	ABCC9	O60706	1549 aa		54.3	■■■■■ 6.28
DCUN1D4-222	ENST00000513800	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		52.12	■■■■■ 5.93
DCUN1D4-222	ENST00000513800	NACAD	O15069	1562 aa		51.94	■■■■■ 5.91
DCUN1D4-222	ENST00000513800	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		51.77	■■■■■ 5.88
DCUN1D4-222	ENST00000513800	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		51.49	■■■■■ 5.83
DCUN1D4-222	ENST00000513800	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	51.29	■■■■■ 5.8
DCUN1D4-222	ENST00000513800	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		51.08	■■■■■ 5.77
DCUN1D4-222	ENST00000513800	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		50.76	■■■■■ 5.72
DCUN1D4-222	ENST00000513800	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	50.65	■■■■■ 5.7
DCUN1D4-222	ENST00000513800	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		50.42	■■■■■ 5.66
DCUN1D4-222	ENST00000513800	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		50.17	■■■■■ 5.62
DCUN1D4-222	ENST00000513800	SCRIB	Q14160	1630 aa		50.17	■■■■■ 5.62
DCUN1D4-222	ENST00000513800	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		50.06	■■■■■ 5.6
DCUN1D4-222	ENST00000513800	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	49.2	■■■■■ 5.47
DCUN1D4-222	ENST00000513800	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		49.1	■■■■■ 5.45
DCUN1D4-222	ENST00000513800	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		48.9	■■■■■ 5.42
DCUN1D4-222	ENST00000513800	SMARCA4	P51532	1647 aa		47.96	■■■■■ 5.27
DCUN1D4-222	ENST00000513800	NCAPD3	P42695	1498 aa		47.91	■■■■■ 5.26
DCUN1D4-222	ENST00000513800	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	47.9	■■■■■ 5.26
DCUN1D4-222	ENST00000513800	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		47.83	■■■■■ 5.25
DCUN1D4-222	ENST00000513800	SMARCA2	P51531	1590 aa		47.82	■■■■■ 5.25
DCUN1D4-222	ENST00000513800	HMGXB3	Q12766	1538 aa		47.65	■■■■■ 5.22
DCUN1D4-222	ENST00000513800	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		47.52	■■■■■ 5.2
DCUN1D4-222	ENST00000513800	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		47.48	■■■■■ 5.19
DCUN1D4-222	ENST00000513800	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	47.46	■■■■■ 5.19
DCUN1D4-222	ENST00000513800	ERCC6	Q03468	1493 aa		46.95	■■■■■ 5.11
DCUN1D4-222	ENST00000513800	WIZ	O95785	1651 aa		46.94	■■■■■ 5.1
DCUN1D4-222	ENST00000513800	NES	P48681	1621 aa		46.81	■■■■■ 5.08
DCUN1D4-222	ENST00000513800	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	46.8	■■■■■ 5.08
DCUN1D4-222	ENST00000513800	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		46.74	■■■■■ 5.07
DCUN1D4-222	ENST00000513800	CUX2	O14529	1486 aa		46.63	■■■■■ 5.05
DCUN1D4-222	ENST00000513800	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		46.5	■■■■■ 5.03
DCUN1D4-222	ENST00000513800	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		46.49	■■■■■ 5.03
DCUN1D4-222	ENST00000513800	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	46.49	■■■■■ 5.03
DCUN1D4-222	ENST00000513800	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		46.25	■■■■■ 4.99
DCUN1D4-222	ENST00000513800	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	46.24	■■■■■ 4.99
DCUN1D4-222	ENST00000513800	CFTR	P13569	1480 aa		46.11	■■■■■ 4.97
DCUN1D4-222	ENST00000513800	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		45.99	■■■■■ 4.95
DCUN1D4-222	ENST00000513800	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		45.97	■■■■■ 4.95
DCUN1D4-222	ENST00000513800	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		45.95	■■■■■ 4.95
DCUN1D4-222	ENST00000513800	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		45.91	■■■■■ 4.94
DCUN1D4-222	ENST00000513800	WDR62	O43379	1518 aa		45.82	■■■■■ 4.93
DCUN1D4-222	ENST00000513800	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		45.69	■■■■■ 4.9
DCUN1D4-222	ENST00000513800	PRDM2	Q13029	1718 aa		45.69	■■■■■ 4.9
DCUN1D4-222	ENST00000513800	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	45.47	■■■■■ 4.87
DCUN1D4-222	ENST00000513800	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	45.28	■■■■■ 4.84
DCUN1D4-222	ENST00000513800	ABCC8	Q09428	1581 aa		45.22	■■■■■ 4.83
DCUN1D4-222	ENST00000513800	TOPBP1	Q92547	1522 aa		45.14	■■■■■ 4.82
DCUN1D4-222	ENST00000513800	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		45.07	■■■■■ 4.81
DCUN1D4-222	ENST00000513800	IFT140	Q96RY7	1462 aa		45.04	■■■■■ 4.8
DCUN1D4-222	ENST00000513800	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	44.76	■■■■■ 4.76
DCUN1D4-222	ENST00000513800	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	44.73	■■■■■ 4.75
DCUN1D4-222	ENST00000513800	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	44.65	■■■■■ 4.74
DCUN1D4-222	ENST00000513800	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		44.61	■■■■■ 4.73
DCUN1D4-222	ENST00000513800	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	44.6	■■■■■ 4.73
DCUN1D4-222	ENST00000513800	CUX1	P39880	1505 aa		44.59	■■■■■ 4.73
DCUN1D4-222	ENST00000513800	SOGA1	O94964	1423 aa		44.57	■■■■■ 4.72
DCUN1D4-222	ENST00000513800	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		44.55	■■■■■ 4.72
DCUN1D4-222	ENST00000513800	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		44.49	■■■■■ 4.71
DCUN1D4-222	ENST00000513800	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	44.48	■■■■■ 4.71
DCUN1D4-222	ENST00000513800	WDR97	A6NE52	1622 aa		44.4	■■■■■ 4.7
DCUN1D4-222	ENST00000513800	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	44.33	■■■■■ 4.69
DCUN1D4-222	ENST00000513800	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	44.2	■■■■■ 4.67
DCUN1D4-222	ENST00000513800	GRIN2B	Q13224	1484 aa		44.13	■■■■■ 4.65
DCUN1D4-222	ENST00000513800	TOP2B	Q02880	1626 aa		44.13	■■■■■ 4.65
DCUN1D4-222	ENST00000513800	FBLN2	P98095	1184 aa		44.12	■■■■■ 4.65
DCUN1D4-222	ENST00000513800	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		44.12	■■■■■ 4.65
DCUN1D4-222	ENST00000513800	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		44.1	■■■■■ 4.65
DCUN1D4-222	ENST00000513800	CHD1	O14646	1710 aa		44.1	■■■■■ 4.65
DCUN1D4-222	ENST00000513800	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		44.08	■■■■■ 4.65
DCUN1D4-222	ENST00000513800	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	44.08	■■■■■ 4.65
DCUN1D4-222	ENST00000513800	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		44.05	■■■■■ 4.64
DCUN1D4-222	ENST00000513800	SYNJ1	O43426	1573 aa		44.03	■■■■■ 4.64
DCUN1D4-222	ENST00000513800	TRIM41	Q8WV44	630 aa		43.99	■■■■■ 4.63
DCUN1D4-222	ENST00000513800	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	43.95	■■■■■ 4.63
DCUN1D4-222	ENST00000513800	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		43.95	■■■■■ 4.63
DCUN1D4-222	ENST00000513800	PBRM1	Q86U86	1689 aa		43.93	■■■■■ 4.62
DCUN1D4-222	ENST00000513800	SYNJ2	O15056	1496 aa		43.89	■■■■■ 4.62
DCUN1D4-222	ENST00000513800	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		43.85	■■■■■ 4.61
DCUN1D4-222	ENST00000513800	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		43.85	■■■■■ 4.61
DCUN1D4-222	ENST00000513800	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		43.85	■■■■■ 4.61
DCUN1D4-222	ENST00000513800	ARHGEF11	O15085	1522 aa		43.83	■■■■■ 4.61
DCUN1D4-222	ENST00000513800	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		43.64	■■■■■ 4.58
DCUN1D4-222	ENST00000513800	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		43.62	■■■■■ 4.57
DCUN1D4-222	ENST00000513800	ADAMTS12	P58397	1594 aa		43.58	■■■■■ 4.57
DCUN1D4-222	ENST00000513800	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		43.55	■■■■■ 4.56
DCUN1D4-222	ENST00000513800	GRIN2A	Q12879	1464 aa		43.53	■■■■■ 4.56
DCUN1D4-222	ENST00000513800	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		43.46	■■■■■ 4.55
DCUN1D4-222	ENST00000513800	ARAP1	Q96P48	1450 aa		43.42	■■■■■ 4.54
DCUN1D4-222	ENST00000513800	NUP160	Q12769	1436 aa		43.35	■■■■■ 4.53
DCUN1D4-222	ENST00000513800	KIF27	Q86VH2	1401 aa		43.35	■■■■■ 4.53
DCUN1D4-222	ENST00000513800	CEP170	Q5SW79	1584 aa		43.28	■■■■■ 4.52
DCUN1D4-222	ENST00000513800	IGF1R	P08069	1367 aa		43.16	■■■■■ 4.5
DCUN1D4-222	ENST00000513800	CUL7	Q14999	1698 aa		43.13	■■■■■ 4.49
DCUN1D4-222	ENST00000513800	SHROOM2	Q13796	1616 aa		43.04	■■■■■ 4.48
DCUN1D4-222	ENST00000513800	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		42.94	■■■■■ 4.46
DCUN1D4-222	ENST00000513800	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		42.93	■■■■■ 4.46
DCUN1D4-222	ENST00000513800	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		42.92	■■■■■ 4.46

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