Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHARPINQ9H0F6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHARPINQ9H0F6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHARPINQ9H0F6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHARPINQ9H0F6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHARPINQ9H0F6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHARPINQ9H0F6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHARPINQ9H0F6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHARPINQ9H0F6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHARPINQ9H0F6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHARPINQ9H0F6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHARPINQ9H0F6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHARPINQ9H0F6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHARPINQ9H0F6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHARPINQ9H0F6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHARPINQ9H0F6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHARPINQ9H0F6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHARPINQ9H0F6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHARPINQ9H0F6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHARPINQ9H0F6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHARPINQ9H0F6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHARPINQ9H0F6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHARPINQ9H0F6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHARPINQ9H0F6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHARPINQ9H0F6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHARPINQ9H0F6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHARPINQ9H0F6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHARPINQ9H0F6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHARPINQ9H0F6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHARPINQ9H0F6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHARPINQ9H0F6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHARPINQ9H0F6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHARPINQ9H0F6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHARPINQ9H0F6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHARPINQ9H0F6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHARPINQ9H0F6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHARPINQ9H0F6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHARPINQ9H0F6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHARPINQ9H0F6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHARPINQ9H0F6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHARPINQ9H0F6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHARPINQ9H0F6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHARPINQ9H0F6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHARPINQ9H0F6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHARPINQ9H0F6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHARPINQ9H0F6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHARPINQ9H0F6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHARPINQ9H0F6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHARPINQ9H0F6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHARPINQ9H0F6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHARPINQ9H0F6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SHARPINQ9H0F6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHARPINQ9H0F6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHARPINQ9H0F6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SHARPINQ9H0F6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHARPINQ9H0F6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHARPINQ9H0F6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHARPINQ9H0F6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHARPINQ9H0F6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHARPINQ9H0F6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHARPINQ9H0F6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHARPINQ9H0F6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SHARPINQ9H0F6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHARPINQ9H0F6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHARPINQ9H0F6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHARPINQ9H0F6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHARPINQ9H0F6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHARPINQ9H0F6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHARPINQ9H0F6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHARPINQ9H0F6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHARPINQ9H0F6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHARPINQ9H0F6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHARPINQ9H0F6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHARPINQ9H0F6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHARPINQ9H0F6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHARPINQ9H0F6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHARPINQ9H0F6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHARPINQ9H0F6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHARPINQ9H0F6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHARPINQ9H0F6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHARPINQ9H0F6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHARPINQ9H0F6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHARPINQ9H0F6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHARPINQ9H0F6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SHARPINQ9H0F6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHARPINQ9H0F6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHARPINQ9H0F6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHARPINQ9H0F6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHARPINQ9H0F6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHARPINQ9H0F6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHARPINQ9H0F6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHARPINQ9H0F6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SHARPINQ9H0F6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHARPINQ9H0F6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHARPINQ9H0F6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHARPINQ9H0F6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHARPINQ9H0F6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHARPINQ9H0F6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHARPINQ9H0F6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHARPINQ9H0F6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms