Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ6

CHRNA10, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA10Q9GZZ6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHRNA10Q9GZZ6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNA10Q9GZZ6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNA10Q9GZZ6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNA10Q9GZZ6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNA10Q9GZZ6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNA10Q9GZZ6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRNA10Q9GZZ6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRNA10Q9GZZ6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRNA10Q9GZZ6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRNA10Q9GZZ6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHRNA10Q9GZZ6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRNA10Q9GZZ6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRNA10Q9GZZ6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNA10Q9GZZ6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNA10Q9GZZ6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNA10Q9GZZ6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNA10Q9GZZ6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNA10Q9GZZ6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNA10Q9GZZ6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNA10Q9GZZ6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNA10Q9GZZ6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNA10Q9GZZ6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNA10Q9GZZ6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNA10Q9GZZ6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRNA10Q9GZZ6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRNA10Q9GZZ6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRNA10Q9GZZ6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHRNA10Q9GZZ6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CHRNA10Q9GZZ6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHRNA10Q9GZZ6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHRNA10Q9GZZ6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRNA10Q9GZZ6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRNA10Q9GZZ6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRNA10Q9GZZ6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHRNA10Q9GZZ6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRNA10Q9GZZ6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRNA10Q9GZZ6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRNA10Q9GZZ6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRNA10Q9GZZ6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRNA10Q9GZZ6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRNA10Q9GZZ6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNA10Q9GZZ6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRNA10Q9GZZ6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRNA10Q9GZZ6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRNA10Q9GZZ6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNA10Q9GZZ6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNA10Q9GZZ6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNA10Q9GZZ6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNA10Q9GZZ6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNA10Q9GZZ6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNA10Q9GZZ6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNA10Q9GZZ6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNA10Q9GZZ6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNA10Q9GZZ6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNA10Q9GZZ6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNA10Q9GZZ6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNA10Q9GZZ6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNA10Q9GZZ6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNA10Q9GZZ6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA10Q9GZZ6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA10Q9GZZ6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHRNA10Q9GZZ6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRNA10Q9GZZ6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRNA10Q9GZZ6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNA10Q9GZZ6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNA10Q9GZZ6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNA10Q9GZZ6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNA10Q9GZZ6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHRNA10Q9GZZ6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHRNA10Q9GZZ6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRNA10Q9GZZ6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRNA10Q9GZZ6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRNA10Q9GZZ6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRNA10Q9GZZ6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRNA10Q9GZZ6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRNA10Q9GZZ6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHRNA10Q9GZZ6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHRNA10Q9GZZ6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA10Q9GZZ6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA10Q9GZZ6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNA10Q9GZZ6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNA10Q9GZZ6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNA10Q9GZZ6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNA10Q9GZZ6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNA10Q9GZZ6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHRNA10Q9GZZ6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNA10Q9GZZ6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRNA10Q9GZZ6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNA10Q9GZZ6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHRNA10Q9GZZ6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHRNA10Q9GZZ6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHRNA10Q9GZZ6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHRNA10Q9GZZ6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHRNA10Q9GZZ6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHRNA10Q9GZZ6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRNA10Q9GZZ6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRNA10Q9GZZ6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRNA10Q9GZZ6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNA10Q9GZZ6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms