Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC7

ABCA2, ATP-binding cassette sub-family A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA2Q9BZC7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCA2Q9BZC7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCA2Q9BZC7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCA2Q9BZC7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCA2Q9BZC7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCA2Q9BZC7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCA2Q9BZC7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCA2Q9BZC7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCA2Q9BZC7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCA2Q9BZC7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCA2Q9BZC7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCA2Q9BZC7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCA2Q9BZC7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCA2Q9BZC7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCA2Q9BZC7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCA2Q9BZC7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCA2Q9BZC7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCA2Q9BZC7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCA2Q9BZC7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCA2Q9BZC7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCA2Q9BZC7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCA2Q9BZC7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCA2Q9BZC7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCA2Q9BZC7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCA2Q9BZC7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCA2Q9BZC7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCA2Q9BZC7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCA2Q9BZC7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCA2Q9BZC7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCA2Q9BZC7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCA2Q9BZC7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCA2Q9BZC7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCA2Q9BZC7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCA2Q9BZC7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCA2Q9BZC7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCA2Q9BZC7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCA2Q9BZC7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCA2Q9BZC7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCA2Q9BZC7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCA2Q9BZC7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCA2Q9BZC7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCA2Q9BZC7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCA2Q9BZC7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCA2Q9BZC7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCA2Q9BZC7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCA2Q9BZC7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCA2Q9BZC7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCA2Q9BZC7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCA2Q9BZC7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCA2Q9BZC7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCA2Q9BZC7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCA2Q9BZC7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCA2Q9BZC7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCA2Q9BZC7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCA2Q9BZC7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCA2Q9BZC7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCA2Q9BZC7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCA2Q9BZC7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCA2Q9BZC7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCA2Q9BZC7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCA2Q9BZC7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCA2Q9BZC7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCA2Q9BZC7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCA2Q9BZC7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCA2Q9BZC7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCA2Q9BZC7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCA2Q9BZC7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCA2Q9BZC7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCA2Q9BZC7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCA2Q9BZC7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCA2Q9BZC7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCA2Q9BZC7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCA2Q9BZC7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCA2Q9BZC7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCA2Q9BZC7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCA2Q9BZC7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCA2Q9BZC7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCA2Q9BZC7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCA2Q9BZC7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCA2Q9BZC7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCA2Q9BZC7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCA2Q9BZC7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCA2Q9BZC7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCA2Q9BZC7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCA2Q9BZC7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ABCA2Q9BZC7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCA2Q9BZC7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCA2Q9BZC7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCA2Q9BZC7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCA2Q9BZC7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCA2Q9BZC7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCA2Q9BZC7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCA2Q9BZC7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCA2Q9BZC7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCA2Q9BZC7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCA2Q9BZC7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCA2Q9BZC7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCA2Q9BZC7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCA2Q9BZC7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCA2Q9BZC7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms