Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX2

TBC1D2, TBC1 domain family member 2A, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D2Q9BYX2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TBC1D2Q9BYX2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TBC1D2Q9BYX2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TBC1D2Q9BYX2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
TBC1D2Q9BYX2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TBC1D2Q9BYX2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TBC1D2Q9BYX2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TBC1D2Q9BYX2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TBC1D2Q9BYX2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
TBC1D2Q9BYX2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TBC1D2Q9BYX2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TBC1D2Q9BYX2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TBC1D2Q9BYX2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TBC1D2Q9BYX2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TBC1D2Q9BYX2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TBC1D2Q9BYX2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TBC1D2Q9BYX2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TBC1D2Q9BYX2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TBC1D2Q9BYX2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TBC1D2Q9BYX2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TBC1D2Q9BYX2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TBC1D2Q9BYX2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TBC1D2Q9BYX2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TBC1D2Q9BYX2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TBC1D2Q9BYX2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TBC1D2Q9BYX2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TBC1D2Q9BYX2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TBC1D2Q9BYX2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
TBC1D2Q9BYX2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TBC1D2Q9BYX2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TBC1D2Q9BYX2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TBC1D2Q9BYX2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TBC1D2Q9BYX2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TBC1D2Q9BYX2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TBC1D2Q9BYX2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TBC1D2Q9BYX2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TBC1D2Q9BYX2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TBC1D2Q9BYX2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TBC1D2Q9BYX2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TBC1D2Q9BYX2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TBC1D2Q9BYX2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TBC1D2Q9BYX2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TBC1D2Q9BYX2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
TBC1D2Q9BYX2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TBC1D2Q9BYX2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TBC1D2Q9BYX2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TBC1D2Q9BYX2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TBC1D2Q9BYX2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.89
TBC1D2Q9BYX2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TBC1D2Q9BYX2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TBC1D2Q9BYX2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TBC1D2Q9BYX2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TBC1D2Q9BYX2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TBC1D2Q9BYX2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TBC1D2Q9BYX2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
TBC1D2Q9BYX2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TBC1D2Q9BYX2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TBC1D2Q9BYX2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TBC1D2Q9BYX2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TBC1D2Q9BYX2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TBC1D2Q9BYX2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TBC1D2Q9BYX2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
TBC1D2Q9BYX2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TBC1D2Q9BYX2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TBC1D2Q9BYX2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TBC1D2Q9BYX2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
TBC1D2Q9BYX2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TBC1D2Q9BYX2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TBC1D2Q9BYX2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TBC1D2Q9BYX2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TBC1D2Q9BYX2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
TBC1D2Q9BYX2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
TBC1D2Q9BYX2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
TBC1D2Q9BYX2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
TBC1D2Q9BYX2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TBC1D2Q9BYX2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TBC1D2Q9BYX2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TBC1D2Q9BYX2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TBC1D2Q9BYX2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
TBC1D2Q9BYX2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TBC1D2Q9BYX2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
TBC1D2Q9BYX2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TBC1D2Q9BYX2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TBC1D2Q9BYX2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TBC1D2Q9BYX2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
TBC1D2Q9BYX2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.95■■■□□ 2.86
TBC1D2Q9BYX2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TBC1D2Q9BYX2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TBC1D2Q9BYX2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TBC1D2Q9BYX2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TBC1D2Q9BYX2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TBC1D2Q9BYX2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
TBC1D2Q9BYX2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TBC1D2Q9BYX2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
TBC1D2Q9BYX2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
TBC1D2Q9BYX2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TBC1D2Q9BYX2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TBC1D2Q9BYX2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TBC1D2Q9BYX2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TBC1D2Q9BYX2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.4 ms