Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TDRD1Q9BXT4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TDRD1Q9BXT4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TDRD1Q9BXT4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TDRD1Q9BXT4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TDRD1Q9BXT4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TDRD1Q9BXT4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TDRD1Q9BXT4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TDRD1Q9BXT4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TDRD1Q9BXT4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TDRD1Q9BXT4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TDRD1Q9BXT4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TDRD1Q9BXT4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TDRD1Q9BXT4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TDRD1Q9BXT4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TDRD1Q9BXT4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TDRD1Q9BXT4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TDRD1Q9BXT4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TDRD1Q9BXT4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TDRD1Q9BXT4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TDRD1Q9BXT4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TDRD1Q9BXT4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TDRD1Q9BXT4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TDRD1Q9BXT4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TDRD1Q9BXT4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TDRD1Q9BXT4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TDRD1Q9BXT4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TDRD1Q9BXT4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TDRD1Q9BXT4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TDRD1Q9BXT4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TDRD1Q9BXT4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TDRD1Q9BXT4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TDRD1Q9BXT4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TDRD1Q9BXT4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TDRD1Q9BXT4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TDRD1Q9BXT4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TDRD1Q9BXT4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TDRD1Q9BXT4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TDRD1Q9BXT4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TDRD1Q9BXT4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TDRD1Q9BXT4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TDRD1Q9BXT4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TDRD1Q9BXT4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TDRD1Q9BXT4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TDRD1Q9BXT4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TDRD1Q9BXT4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TDRD1Q9BXT4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TDRD1Q9BXT4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TDRD1Q9BXT4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TDRD1Q9BXT4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TDRD1Q9BXT4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TDRD1Q9BXT4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TDRD1Q9BXT4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TDRD1Q9BXT4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TDRD1Q9BXT4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TDRD1Q9BXT4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TDRD1Q9BXT4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TDRD1Q9BXT4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TDRD1Q9BXT4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TDRD1Q9BXT4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TDRD1Q9BXT4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TDRD1Q9BXT4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TDRD1Q9BXT4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TDRD1Q9BXT4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TDRD1Q9BXT4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TDRD1Q9BXT4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TDRD1Q9BXT4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TDRD1Q9BXT4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TDRD1Q9BXT4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TDRD1Q9BXT4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TDRD1Q9BXT4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TDRD1Q9BXT4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TDRD1Q9BXT4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TDRD1Q9BXT4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TDRD1Q9BXT4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TDRD1Q9BXT4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TDRD1Q9BXT4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TDRD1Q9BXT4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TDRD1Q9BXT4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TDRD1Q9BXT4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TDRD1Q9BXT4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TDRD1Q9BXT4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TDRD1Q9BXT4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TDRD1Q9BXT4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TDRD1Q9BXT4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TDRD1Q9BXT4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TDRD1Q9BXT4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TDRD1Q9BXT4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TDRD1Q9BXT4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TDRD1Q9BXT4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TDRD1Q9BXT4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TDRD1Q9BXT4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TDRD1Q9BXT4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TDRD1Q9BXT4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TDRD1Q9BXT4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TDRD1Q9BXT4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TDRD1Q9BXT4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TDRD1Q9BXT4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TDRD1Q9BXT4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TDRD1Q9BXT4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms