Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNPPD1Q9BV87 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNPPD1Q9BV87 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CNPPD1Q9BV87 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNPPD1Q9BV87 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNPPD1Q9BV87 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNPPD1Q9BV87 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CNPPD1Q9BV87 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNPPD1Q9BV87 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNPPD1Q9BV87 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNPPD1Q9BV87 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNPPD1Q9BV87 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNPPD1Q9BV87 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNPPD1Q9BV87 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNPPD1Q9BV87 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNPPD1Q9BV87 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNPPD1Q9BV87 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNPPD1Q9BV87 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNPPD1Q9BV87 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNPPD1Q9BV87 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CNPPD1Q9BV87 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNPPD1Q9BV87 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNPPD1Q9BV87 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNPPD1Q9BV87 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNPPD1Q9BV87 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNPPD1Q9BV87 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNPPD1Q9BV87 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNPPD1Q9BV87 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNPPD1Q9BV87 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNPPD1Q9BV87 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNPPD1Q9BV87 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNPPD1Q9BV87 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNPPD1Q9BV87 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNPPD1Q9BV87 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNPPD1Q9BV87 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNPPD1Q9BV87 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNPPD1Q9BV87 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNPPD1Q9BV87 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNPPD1Q9BV87 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNPPD1Q9BV87 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNPPD1Q9BV87 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNPPD1Q9BV87 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNPPD1Q9BV87 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNPPD1Q9BV87 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNPPD1Q9BV87 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNPPD1Q9BV87 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNPPD1Q9BV87 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNPPD1Q9BV87 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNPPD1Q9BV87 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CNPPD1Q9BV87 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNPPD1Q9BV87 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CNPPD1Q9BV87 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNPPD1Q9BV87 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CNPPD1Q9BV87 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNPPD1Q9BV87 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNPPD1Q9BV87 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNPPD1Q9BV87 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNPPD1Q9BV87 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
CNPPD1Q9BV87 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNPPD1Q9BV87 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNPPD1Q9BV87 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNPPD1Q9BV87 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNPPD1Q9BV87 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNPPD1Q9BV87 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNPPD1Q9BV87 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNPPD1Q9BV87 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNPPD1Q9BV87 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNPPD1Q9BV87 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNPPD1Q9BV87 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNPPD1Q9BV87 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CNPPD1Q9BV87 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNPPD1Q9BV87 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNPPD1Q9BV87 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNPPD1Q9BV87 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNPPD1Q9BV87 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNPPD1Q9BV87 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNPPD1Q9BV87 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNPPD1Q9BV87 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CNPPD1Q9BV87 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNPPD1Q9BV87 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNPPD1Q9BV87 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNPPD1Q9BV87 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNPPD1Q9BV87 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNPPD1Q9BV87 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNPPD1Q9BV87 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNPPD1Q9BV87 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNPPD1Q9BV87 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNPPD1Q9BV87 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNPPD1Q9BV87 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNPPD1Q9BV87 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNPPD1Q9BV87 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CNPPD1Q9BV87 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNPPD1Q9BV87 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNPPD1Q9BV87 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNPPD1Q9BV87 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNPPD1Q9BV87 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNPPD1Q9BV87 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNPPD1Q9BV87 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNPPD1Q9BV87 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNPPD1Q9BV87 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms