Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF4Q9BUZ4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAF4Q9BUZ4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF4Q9BUZ4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAF4Q9BUZ4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF4Q9BUZ4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAF4Q9BUZ4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF4Q9BUZ4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF4Q9BUZ4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAF4Q9BUZ4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF4Q9BUZ4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAF4Q9BUZ4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF4Q9BUZ4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAF4Q9BUZ4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF4Q9BUZ4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF4Q9BUZ4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAF4Q9BUZ4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAF4Q9BUZ4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF4Q9BUZ4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAF4Q9BUZ4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAF4Q9BUZ4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAF4Q9BUZ4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAF4Q9BUZ4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF4Q9BUZ4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAF4Q9BUZ4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRAF4Q9BUZ4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF4Q9BUZ4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF4Q9BUZ4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAF4Q9BUZ4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF4Q9BUZ4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAF4Q9BUZ4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF4Q9BUZ4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAF4Q9BUZ4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF4Q9BUZ4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF4Q9BUZ4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAF4Q9BUZ4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF4Q9BUZ4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF4Q9BUZ4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAF4Q9BUZ4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAF4Q9BUZ4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAF4Q9BUZ4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF4Q9BUZ4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF4Q9BUZ4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF4Q9BUZ4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF4Q9BUZ4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF4Q9BUZ4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAF4Q9BUZ4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAF4Q9BUZ4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAF4Q9BUZ4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF4Q9BUZ4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF4Q9BUZ4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF4Q9BUZ4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAF4Q9BUZ4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF4Q9BUZ4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAF4Q9BUZ4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAF4Q9BUZ4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAF4Q9BUZ4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAF4Q9BUZ4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAF4Q9BUZ4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAF4Q9BUZ4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF4Q9BUZ4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF4Q9BUZ4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF4Q9BUZ4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF4Q9BUZ4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF4Q9BUZ4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF4Q9BUZ4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF4Q9BUZ4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF4Q9BUZ4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF4Q9BUZ4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF4Q9BUZ4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF4Q9BUZ4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF4Q9BUZ4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF4Q9BUZ4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF4Q9BUZ4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF4Q9BUZ4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF4Q9BUZ4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF4Q9BUZ4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF4Q9BUZ4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF4Q9BUZ4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRAF4Q9BUZ4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRAF4Q9BUZ4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF4Q9BUZ4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF4Q9BUZ4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF4Q9BUZ4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF4Q9BUZ4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF4Q9BUZ4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF4Q9BUZ4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF4Q9BUZ4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF4Q9BUZ4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF4Q9BUZ4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF4Q9BUZ4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF4Q9BUZ4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF4Q9BUZ4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAF4Q9BUZ4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAF4Q9BUZ4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAF4Q9BUZ4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF4Q9BUZ4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF4Q9BUZ4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF4Q9BUZ4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF4Q9BUZ4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms