Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM43Q9BTV4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM43Q9BTV4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM43Q9BTV4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM43Q9BTV4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM43Q9BTV4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM43Q9BTV4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM43Q9BTV4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM43Q9BTV4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM43Q9BTV4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM43Q9BTV4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM43Q9BTV4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM43Q9BTV4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM43Q9BTV4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM43Q9BTV4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM43Q9BTV4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM43Q9BTV4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM43Q9BTV4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM43Q9BTV4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM43Q9BTV4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM43Q9BTV4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM43Q9BTV4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM43Q9BTV4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM43Q9BTV4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM43Q9BTV4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM43Q9BTV4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM43Q9BTV4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM43Q9BTV4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM43Q9BTV4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM43Q9BTV4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM43Q9BTV4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM43Q9BTV4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM43Q9BTV4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM43Q9BTV4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM43Q9BTV4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM43Q9BTV4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM43Q9BTV4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM43Q9BTV4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM43Q9BTV4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM43Q9BTV4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM43Q9BTV4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM43Q9BTV4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM43Q9BTV4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM43Q9BTV4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM43Q9BTV4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM43Q9BTV4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM43Q9BTV4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM43Q9BTV4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM43Q9BTV4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM43Q9BTV4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM43Q9BTV4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM43Q9BTV4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM43Q9BTV4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM43Q9BTV4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM43Q9BTV4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM43Q9BTV4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM43Q9BTV4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM43Q9BTV4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM43Q9BTV4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM43Q9BTV4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM43Q9BTV4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM43Q9BTV4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM43Q9BTV4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM43Q9BTV4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM43Q9BTV4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM43Q9BTV4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM43Q9BTV4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM43Q9BTV4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM43Q9BTV4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM43Q9BTV4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM43Q9BTV4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM43Q9BTV4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM43Q9BTV4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM43Q9BTV4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM43Q9BTV4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM43Q9BTV4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM43Q9BTV4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM43Q9BTV4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM43Q9BTV4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM43Q9BTV4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM43Q9BTV4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM43Q9BTV4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM43Q9BTV4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM43Q9BTV4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM43Q9BTV4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM43Q9BTV4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM43Q9BTV4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM43Q9BTV4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM43Q9BTV4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM43Q9BTV4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM43Q9BTV4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM43Q9BTV4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM43Q9BTV4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM43Q9BTV4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM43Q9BTV4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM43Q9BTV4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM43Q9BTV4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM43Q9BTV4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM43Q9BTV4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM43Q9BTV4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms