Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV3

SLC50A1, Sugar transporter SWEET1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC50A1Q9BRV3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC50A1Q9BRV3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC50A1Q9BRV3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC50A1Q9BRV3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC50A1Q9BRV3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC50A1Q9BRV3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC50A1Q9BRV3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC50A1Q9BRV3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC50A1Q9BRV3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC50A1Q9BRV3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC50A1Q9BRV3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC50A1Q9BRV3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC50A1Q9BRV3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC50A1Q9BRV3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC50A1Q9BRV3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC50A1Q9BRV3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC50A1Q9BRV3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC50A1Q9BRV3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC50A1Q9BRV3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC50A1Q9BRV3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC50A1Q9BRV3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC50A1Q9BRV3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC50A1Q9BRV3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC50A1Q9BRV3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC50A1Q9BRV3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC50A1Q9BRV3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC50A1Q9BRV3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC50A1Q9BRV3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC50A1Q9BRV3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC50A1Q9BRV3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC50A1Q9BRV3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC50A1Q9BRV3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC50A1Q9BRV3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC50A1Q9BRV3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC50A1Q9BRV3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC50A1Q9BRV3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC50A1Q9BRV3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC50A1Q9BRV3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC50A1Q9BRV3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC50A1Q9BRV3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC50A1Q9BRV3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC50A1Q9BRV3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC50A1Q9BRV3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC50A1Q9BRV3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC50A1Q9BRV3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC50A1Q9BRV3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC50A1Q9BRV3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC50A1Q9BRV3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC50A1Q9BRV3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC50A1Q9BRV3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC50A1Q9BRV3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC50A1Q9BRV3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC50A1Q9BRV3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC50A1Q9BRV3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC50A1Q9BRV3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC50A1Q9BRV3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC50A1Q9BRV3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC50A1Q9BRV3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC50A1Q9BRV3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC50A1Q9BRV3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC50A1Q9BRV3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC50A1Q9BRV3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC50A1Q9BRV3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC50A1Q9BRV3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC50A1Q9BRV3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC50A1Q9BRV3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC50A1Q9BRV3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC50A1Q9BRV3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC50A1Q9BRV3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC50A1Q9BRV3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC50A1Q9BRV3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC50A1Q9BRV3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC50A1Q9BRV3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC50A1Q9BRV3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC50A1Q9BRV3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC50A1Q9BRV3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC50A1Q9BRV3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC50A1Q9BRV3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC50A1Q9BRV3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC50A1Q9BRV3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC50A1Q9BRV3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC50A1Q9BRV3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC50A1Q9BRV3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC50A1Q9BRV3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC50A1Q9BRV3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC50A1Q9BRV3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC50A1Q9BRV3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC50A1Q9BRV3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC50A1Q9BRV3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC50A1Q9BRV3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC50A1Q9BRV3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC50A1Q9BRV3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC50A1Q9BRV3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC50A1Q9BRV3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC50A1Q9BRV3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC50A1Q9BRV3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC50A1Q9BRV3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC50A1Q9BRV3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC50A1Q9BRV3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC50A1Q9BRV3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms