Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQG1

SYT3, Synaptotagmin-3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT3Q9BQG1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT3Q9BQG1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT3Q9BQG1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT3Q9BQG1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT3Q9BQG1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT3Q9BQG1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT3Q9BQG1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYT3Q9BQG1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYT3Q9BQG1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYT3Q9BQG1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYT3Q9BQG1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYT3Q9BQG1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYT3Q9BQG1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SYT3Q9BQG1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SYT3Q9BQG1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYT3Q9BQG1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYT3Q9BQG1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYT3Q9BQG1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT3Q9BQG1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT3Q9BQG1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT3Q9BQG1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT3Q9BQG1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT3Q9BQG1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT3Q9BQG1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT3Q9BQG1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SYT3Q9BQG1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SYT3Q9BQG1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYT3Q9BQG1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT3Q9BQG1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT3Q9BQG1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT3Q9BQG1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT3Q9BQG1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYT3Q9BQG1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYT3Q9BQG1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYT3Q9BQG1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYT3Q9BQG1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYT3Q9BQG1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYT3Q9BQG1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT3Q9BQG1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT3Q9BQG1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYT3Q9BQG1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYT3Q9BQG1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYT3Q9BQG1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYT3Q9BQG1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYT3Q9BQG1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYT3Q9BQG1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYT3Q9BQG1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYT3Q9BQG1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYT3Q9BQG1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYT3Q9BQG1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT3Q9BQG1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYT3Q9BQG1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT3Q9BQG1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYT3Q9BQG1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT3Q9BQG1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT3Q9BQG1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SYT3Q9BQG1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT3Q9BQG1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT3Q9BQG1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYT3Q9BQG1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT3Q9BQG1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYT3Q9BQG1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYT3Q9BQG1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT3Q9BQG1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT3Q9BQG1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT3Q9BQG1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYT3Q9BQG1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYT3Q9BQG1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYT3Q9BQG1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT3Q9BQG1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT3Q9BQG1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT3Q9BQG1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT3Q9BQG1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT3Q9BQG1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYT3Q9BQG1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT3Q9BQG1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYT3Q9BQG1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT3Q9BQG1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYT3Q9BQG1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT3Q9BQG1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT3Q9BQG1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYT3Q9BQG1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYT3Q9BQG1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT3Q9BQG1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYT3Q9BQG1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYT3Q9BQG1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SYT3Q9BQG1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT3Q9BQG1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT3Q9BQG1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYT3Q9BQG1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT3Q9BQG1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYT3Q9BQG1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYT3Q9BQG1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT3Q9BQG1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT3Q9BQG1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT3Q9BQG1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYT3Q9BQG1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYT3Q9BQG1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYT3Q9BQG1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SYT3Q9BQG1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms