Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBA1CQ9BQE3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBA1CQ9BQE3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBA1CQ9BQE3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBA1CQ9BQE3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBA1CQ9BQE3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBA1CQ9BQE3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBA1CQ9BQE3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBA1CQ9BQE3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBA1CQ9BQE3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBA1CQ9BQE3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBA1CQ9BQE3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBA1CQ9BQE3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBA1CQ9BQE3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBA1CQ9BQE3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBA1CQ9BQE3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBA1CQ9BQE3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBA1CQ9BQE3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBA1CQ9BQE3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBA1CQ9BQE3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBA1CQ9BQE3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBA1CQ9BQE3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBA1CQ9BQE3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBA1CQ9BQE3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBA1CQ9BQE3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBA1CQ9BQE3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBA1CQ9BQE3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBA1CQ9BQE3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBA1CQ9BQE3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBA1CQ9BQE3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBA1CQ9BQE3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBA1CQ9BQE3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBA1CQ9BQE3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBA1CQ9BQE3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBA1CQ9BQE3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBA1CQ9BQE3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBA1CQ9BQE3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBA1CQ9BQE3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBA1CQ9BQE3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBA1CQ9BQE3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBA1CQ9BQE3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBA1CQ9BQE3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TUBA1CQ9BQE3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBA1CQ9BQE3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBA1CQ9BQE3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBA1CQ9BQE3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBA1CQ9BQE3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBA1CQ9BQE3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBA1CQ9BQE3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBA1CQ9BQE3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBA1CQ9BQE3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBA1CQ9BQE3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBA1CQ9BQE3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBA1CQ9BQE3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBA1CQ9BQE3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBA1CQ9BQE3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBA1CQ9BQE3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBA1CQ9BQE3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBA1CQ9BQE3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBA1CQ9BQE3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBA1CQ9BQE3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TUBA1CQ9BQE3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBA1CQ9BQE3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBA1CQ9BQE3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBA1CQ9BQE3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBA1CQ9BQE3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBA1CQ9BQE3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBA1CQ9BQE3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBA1CQ9BQE3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBA1CQ9BQE3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBA1CQ9BQE3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBA1CQ9BQE3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBA1CQ9BQE3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBA1CQ9BQE3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBA1CQ9BQE3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBA1CQ9BQE3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBA1CQ9BQE3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBA1CQ9BQE3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBA1CQ9BQE3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBA1CQ9BQE3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBA1CQ9BQE3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBA1CQ9BQE3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBA1CQ9BQE3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBA1CQ9BQE3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBA1CQ9BQE3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBA1CQ9BQE3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBA1CQ9BQE3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBA1CQ9BQE3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBA1CQ9BQE3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TUBA1CQ9BQE3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBA1CQ9BQE3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBA1CQ9BQE3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBA1CQ9BQE3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBA1CQ9BQE3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TUBA1CQ9BQE3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBA1CQ9BQE3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBA1CQ9BQE3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBA1CQ9BQE3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBA1CQ9BQE3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBA1CQ9BQE3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms