Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
MYD88Q99836 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
MYD88Q99836 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
MYD88Q99836 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
MYD88Q99836 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
MYD88Q99836 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
MYD88Q99836 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
MYD88Q99836 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
MYD88Q99836 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
MYD88Q99836 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
MYD88Q99836 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
MYD88Q99836 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
MYD88Q99836 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
MYD88Q99836 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
MYD88Q99836 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
MYD88Q99836 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
MYD88Q99836 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
MYD88Q99836 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
MYD88Q99836 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
MYD88Q99836 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
MYD88Q99836 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
MYD88Q99836 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
MYD88Q99836 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
MYD88Q99836 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
MYD88Q99836 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
MYD88Q99836 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
MYD88Q99836 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
MYD88Q99836 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
MYD88Q99836 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
MYD88Q99836 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
MYD88Q99836 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
MYD88Q99836 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
MYD88Q99836 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
MYD88Q99836 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
MYD88Q99836 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
MYD88Q99836 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
MYD88Q99836 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
MYD88Q99836 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
MYD88Q99836 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.08
MYD88Q99836 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
MYD88Q99836 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
MYD88Q99836 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
MYD88Q99836 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
MYD88Q99836 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
MYD88Q99836 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
MYD88Q99836 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
MYD88Q99836 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
MYD88Q99836 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
MYD88Q99836 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
MYD88Q99836 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
MYD88Q99836 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
MYD88Q99836 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
MYD88Q99836 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
MYD88Q99836 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
MYD88Q99836 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
MYD88Q99836 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
MYD88Q99836 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
MYD88Q99836 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
MYD88Q99836 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
MYD88Q99836 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
MYD88Q99836 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
MYD88Q99836 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
MYD88Q99836 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
MYD88Q99836 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
MYD88Q99836 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
MYD88Q99836 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
MYD88Q99836 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.05
MYD88Q99836 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
MYD88Q99836 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
MYD88Q99836 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
MYD88Q99836 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
MYD88Q99836 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
MYD88Q99836 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
MYD88Q99836 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
MYD88Q99836 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
MYD88Q99836 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
MYD88Q99836 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
MYD88Q99836 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
MYD88Q99836 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
MYD88Q99836 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
MYD88Q99836 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
MYD88Q99836 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
MYD88Q99836 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
MYD88Q99836 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
MYD88Q99836 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
MYD88Q99836 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
MYD88Q99836 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
MYD88Q99836 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
MYD88Q99836 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
MYD88Q99836 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
MYD88Q99836 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
MYD88Q99836 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
MYD88Q99836 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
MYD88Q99836 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
MYD88Q99836 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
MYD88Q99836 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
MYD88Q99836 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
MYD88Q99836 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
MYD88Q99836 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
MYD88Q99836 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms