Protein–RNA interactions for Protein: Q99714

HSD17B10, 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase type-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B10Q99714 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HSD17B10Q99714 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HSD17B10Q99714 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HSD17B10Q99714 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HSD17B10Q99714 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSD17B10Q99714 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HSD17B10Q99714 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HSD17B10Q99714 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSD17B10Q99714 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSD17B10Q99714 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HSD17B10Q99714 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSD17B10Q99714 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HSD17B10Q99714 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HSD17B10Q99714 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSD17B10Q99714 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HSD17B10Q99714 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSD17B10Q99714 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HSD17B10Q99714 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HSD17B10Q99714 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HSD17B10Q99714 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HSD17B10Q99714 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HSD17B10Q99714 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSD17B10Q99714 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSD17B10Q99714 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSD17B10Q99714 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HSD17B10Q99714 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSD17B10Q99714 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HSD17B10Q99714 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSD17B10Q99714 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSD17B10Q99714 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSD17B10Q99714 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSD17B10Q99714 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSD17B10Q99714 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSD17B10Q99714 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSD17B10Q99714 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSD17B10Q99714 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSD17B10Q99714 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSD17B10Q99714 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSD17B10Q99714 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSD17B10Q99714 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSD17B10Q99714 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HSD17B10Q99714 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HSD17B10Q99714 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HSD17B10Q99714 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HSD17B10Q99714 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HSD17B10Q99714 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HSD17B10Q99714 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HSD17B10Q99714 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HSD17B10Q99714 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HSD17B10Q99714 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HSD17B10Q99714 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HSD17B10Q99714 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HSD17B10Q99714 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HSD17B10Q99714 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HSD17B10Q99714 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HSD17B10Q99714 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HSD17B10Q99714 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HSD17B10Q99714 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSD17B10Q99714 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSD17B10Q99714 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSD17B10Q99714 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSD17B10Q99714 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HSD17B10Q99714 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HSD17B10Q99714 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HSD17B10Q99714 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HSD17B10Q99714 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HSD17B10Q99714 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HSD17B10Q99714 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HSD17B10Q99714 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HSD17B10Q99714 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HSD17B10Q99714 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HSD17B10Q99714 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HSD17B10Q99714 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HSD17B10Q99714 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HSD17B10Q99714 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HSD17B10Q99714 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HSD17B10Q99714 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HSD17B10Q99714 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HSD17B10Q99714 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HSD17B10Q99714 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HSD17B10Q99714 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HSD17B10Q99714 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSD17B10Q99714 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSD17B10Q99714 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSD17B10Q99714 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSD17B10Q99714 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HSD17B10Q99714 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HSD17B10Q99714 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HSD17B10Q99714 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HSD17B10Q99714 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HSD17B10Q99714 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HSD17B10Q99714 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HSD17B10Q99714 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HSD17B10Q99714 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HSD17B10Q99714 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HSD17B10Q99714 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HSD17B10Q99714 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HSD17B10Q99714 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HSD17B10Q99714 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HSD17B10Q99714 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.7 ms