Protein–RNA interactions for Protein: Q99714

HSD17B10, 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase type-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B10Q99714 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HSD17B10Q99714 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HSD17B10Q99714 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HSD17B10Q99714 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HSD17B10Q99714 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
HSD17B10Q99714 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HSD17B10Q99714 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HSD17B10Q99714 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HSD17B10Q99714 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
HSD17B10Q99714 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HSD17B10Q99714 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HSD17B10Q99714 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HSD17B10Q99714 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HSD17B10Q99714 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HSD17B10Q99714 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HSD17B10Q99714 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HSD17B10Q99714 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HSD17B10Q99714 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HSD17B10Q99714 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HSD17B10Q99714 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HSD17B10Q99714 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HSD17B10Q99714 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HSD17B10Q99714 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HSD17B10Q99714 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HSD17B10Q99714 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HSD17B10Q99714 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSD17B10Q99714 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HSD17B10Q99714 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSD17B10Q99714 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HSD17B10Q99714 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HSD17B10Q99714 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HSD17B10Q99714 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HSD17B10Q99714 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HSD17B10Q99714 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HSD17B10Q99714 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HSD17B10Q99714 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HSD17B10Q99714 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HSD17B10Q99714 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSD17B10Q99714 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSD17B10Q99714 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSD17B10Q99714 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSD17B10Q99714 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HSD17B10Q99714 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSD17B10Q99714 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSD17B10Q99714 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HSD17B10Q99714 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSD17B10Q99714 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSD17B10Q99714 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSD17B10Q99714 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HSD17B10Q99714 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HSD17B10Q99714 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HSD17B10Q99714 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HSD17B10Q99714 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HSD17B10Q99714 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HSD17B10Q99714 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HSD17B10Q99714 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HSD17B10Q99714 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSD17B10Q99714 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSD17B10Q99714 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSD17B10Q99714 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HSD17B10Q99714 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HSD17B10Q99714 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HSD17B10Q99714 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HSD17B10Q99714 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HSD17B10Q99714 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HSD17B10Q99714 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HSD17B10Q99714 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HSD17B10Q99714 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HSD17B10Q99714 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HSD17B10Q99714 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HSD17B10Q99714 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HSD17B10Q99714 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HSD17B10Q99714 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HSD17B10Q99714 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HSD17B10Q99714 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HSD17B10Q99714 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HSD17B10Q99714 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HSD17B10Q99714 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HSD17B10Q99714 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HSD17B10Q99714 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HSD17B10Q99714 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HSD17B10Q99714 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSD17B10Q99714 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSD17B10Q99714 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSD17B10Q99714 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSD17B10Q99714 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HSD17B10Q99714 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HSD17B10Q99714 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HSD17B10Q99714 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HSD17B10Q99714 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HSD17B10Q99714 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HSD17B10Q99714 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HSD17B10Q99714 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HSD17B10Q99714 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HSD17B10Q99714 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HSD17B10Q99714 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HSD17B10Q99714 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSD17B10Q99714 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSD17B10Q99714 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSD17B10Q99714 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms