Protein–RNA interactions for Protein: Q96S94

CCNL2, Cyclin-L2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL2Q96S94 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCNL2Q96S94 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCNL2Q96S94 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCNL2Q96S94 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCNL2Q96S94 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCNL2Q96S94 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNL2Q96S94 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNL2Q96S94 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNL2Q96S94 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNL2Q96S94 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNL2Q96S94 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNL2Q96S94 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNL2Q96S94 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCNL2Q96S94 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCNL2Q96S94 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNL2Q96S94 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNL2Q96S94 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNL2Q96S94 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNL2Q96S94 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNL2Q96S94 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNL2Q96S94 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNL2Q96S94 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCNL2Q96S94 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCNL2Q96S94 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCNL2Q96S94 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCNL2Q96S94 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCNL2Q96S94 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCNL2Q96S94 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNL2Q96S94 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNL2Q96S94 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNL2Q96S94 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNL2Q96S94 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNL2Q96S94 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNL2Q96S94 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNL2Q96S94 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNL2Q96S94 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNL2Q96S94 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNL2Q96S94 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNL2Q96S94 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNL2Q96S94 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNL2Q96S94 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNL2Q96S94 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNL2Q96S94 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNL2Q96S94 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNL2Q96S94 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNL2Q96S94 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNL2Q96S94 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNL2Q96S94 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNL2Q96S94 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNL2Q96S94 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNL2Q96S94 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNL2Q96S94 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNL2Q96S94 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNL2Q96S94 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNL2Q96S94 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNL2Q96S94 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNL2Q96S94 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNL2Q96S94 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNL2Q96S94 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCNL2Q96S94 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCNL2Q96S94 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCNL2Q96S94 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCNL2Q96S94 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCNL2Q96S94 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNL2Q96S94 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNL2Q96S94 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNL2Q96S94 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNL2Q96S94 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCNL2Q96S94 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCNL2Q96S94 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNL2Q96S94 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNL2Q96S94 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCNL2Q96S94 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCNL2Q96S94 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNL2Q96S94 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCNL2Q96S94 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCNL2Q96S94 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNL2Q96S94 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNL2Q96S94 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNL2Q96S94 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCNL2Q96S94 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCNL2Q96S94 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCNL2Q96S94 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCNL2Q96S94 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCNL2Q96S94 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNL2Q96S94 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNL2Q96S94 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNL2Q96S94 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNL2Q96S94 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNL2Q96S94 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNL2Q96S94 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNL2Q96S94 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNL2Q96S94 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNL2Q96S94 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNL2Q96S94 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNL2Q96S94 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNL2Q96S94 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNL2Q96S94 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNL2Q96S94 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNL2Q96S94 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms