Protein–RNA interactions for Protein: Q96S94

CCNL2, Cyclin-L2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL2Q96S94 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCNL2Q96S94 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCNL2Q96S94 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCNL2Q96S94 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCNL2Q96S94 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCNL2Q96S94 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNL2Q96S94 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNL2Q96S94 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNL2Q96S94 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNL2Q96S94 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNL2Q96S94 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNL2Q96S94 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNL2Q96S94 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCNL2Q96S94 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCNL2Q96S94 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNL2Q96S94 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNL2Q96S94 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNL2Q96S94 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNL2Q96S94 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNL2Q96S94 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNL2Q96S94 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNL2Q96S94 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCNL2Q96S94 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCNL2Q96S94 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCNL2Q96S94 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCNL2Q96S94 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCNL2Q96S94 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCNL2Q96S94 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNL2Q96S94 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNL2Q96S94 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNL2Q96S94 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNL2Q96S94 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNL2Q96S94 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNL2Q96S94 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNL2Q96S94 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNL2Q96S94 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNL2Q96S94 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNL2Q96S94 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNL2Q96S94 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNL2Q96S94 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNL2Q96S94 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNL2Q96S94 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNL2Q96S94 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNL2Q96S94 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNL2Q96S94 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNL2Q96S94 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNL2Q96S94 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNL2Q96S94 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNL2Q96S94 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNL2Q96S94 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNL2Q96S94 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNL2Q96S94 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNL2Q96S94 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNL2Q96S94 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNL2Q96S94 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNL2Q96S94 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNL2Q96S94 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNL2Q96S94 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNL2Q96S94 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCNL2Q96S94 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCNL2Q96S94 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCNL2Q96S94 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCNL2Q96S94 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCNL2Q96S94 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNL2Q96S94 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNL2Q96S94 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNL2Q96S94 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNL2Q96S94 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCNL2Q96S94 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCNL2Q96S94 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNL2Q96S94 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNL2Q96S94 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCNL2Q96S94 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCNL2Q96S94 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNL2Q96S94 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCNL2Q96S94 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCNL2Q96S94 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNL2Q96S94 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNL2Q96S94 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNL2Q96S94 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCNL2Q96S94 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCNL2Q96S94 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCNL2Q96S94 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCNL2Q96S94 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCNL2Q96S94 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNL2Q96S94 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNL2Q96S94 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNL2Q96S94 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNL2Q96S94 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNL2Q96S94 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNL2Q96S94 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNL2Q96S94 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCNL2Q96S94 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNL2Q96S94 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNL2Q96S94 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNL2Q96S94 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNL2Q96S94 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNL2Q96S94 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNL2Q96S94 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNL2Q96S94 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms