Protein–RNA interactions for Protein: Q96S44

TP53RK, TP53-regulating kinase, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53RKQ96S44 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TP53RKQ96S44 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TP53RKQ96S44 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TP53RKQ96S44 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TP53RKQ96S44 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TP53RKQ96S44 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TP53RKQ96S44 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TP53RKQ96S44 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TP53RKQ96S44 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TP53RKQ96S44 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TP53RKQ96S44 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TP53RKQ96S44 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TP53RKQ96S44 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TP53RKQ96S44 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TP53RKQ96S44 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TP53RKQ96S44 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TP53RKQ96S44 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TP53RKQ96S44 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TP53RKQ96S44 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TP53RKQ96S44 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TP53RKQ96S44 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TP53RKQ96S44 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TP53RKQ96S44 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TP53RKQ96S44 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TP53RKQ96S44 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TP53RKQ96S44 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TP53RKQ96S44 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TP53RKQ96S44 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TP53RKQ96S44 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TP53RKQ96S44 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TP53RKQ96S44 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TP53RKQ96S44 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TP53RKQ96S44 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TP53RKQ96S44 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TP53RKQ96S44 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TP53RKQ96S44 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TP53RKQ96S44 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TP53RKQ96S44 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TP53RKQ96S44 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TP53RKQ96S44 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TP53RKQ96S44 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TP53RKQ96S44 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TP53RKQ96S44 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TP53RKQ96S44 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TP53RKQ96S44 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TP53RKQ96S44 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TP53RKQ96S44 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TP53RKQ96S44 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TP53RKQ96S44 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TP53RKQ96S44 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TP53RKQ96S44 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TP53RKQ96S44 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TP53RKQ96S44 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TP53RKQ96S44 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TP53RKQ96S44 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TP53RKQ96S44 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TP53RKQ96S44 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TP53RKQ96S44 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TP53RKQ96S44 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TP53RKQ96S44 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TP53RKQ96S44 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TP53RKQ96S44 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TP53RKQ96S44 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TP53RKQ96S44 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TP53RKQ96S44 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TP53RKQ96S44 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TP53RKQ96S44 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TP53RKQ96S44 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TP53RKQ96S44 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TP53RKQ96S44 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TP53RKQ96S44 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TP53RKQ96S44 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TP53RKQ96S44 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TP53RKQ96S44 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TP53RKQ96S44 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TP53RKQ96S44 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TP53RKQ96S44 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TP53RKQ96S44 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TP53RKQ96S44 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TP53RKQ96S44 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TP53RKQ96S44 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TP53RKQ96S44 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TP53RKQ96S44 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TP53RKQ96S44 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TP53RKQ96S44 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TP53RKQ96S44 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TP53RKQ96S44 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TP53RKQ96S44 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TP53RKQ96S44 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TP53RKQ96S44 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TP53RKQ96S44 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TP53RKQ96S44 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TP53RKQ96S44 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TP53RKQ96S44 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TP53RKQ96S44 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TP53RKQ96S44 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TP53RKQ96S44 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TP53RKQ96S44 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TP53RKQ96S44 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TP53RKQ96S44 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms