Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCNX1Q96RV3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCNX1Q96RV3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCNX1Q96RV3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCNX1Q96RV3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCNX1Q96RV3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCNX1Q96RV3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCNX1Q96RV3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCNX1Q96RV3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PCNX1Q96RV3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PCNX1Q96RV3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCNX1Q96RV3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCNX1Q96RV3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCNX1Q96RV3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCNX1Q96RV3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCNX1Q96RV3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCNX1Q96RV3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCNX1Q96RV3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCNX1Q96RV3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCNX1Q96RV3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCNX1Q96RV3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCNX1Q96RV3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCNX1Q96RV3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCNX1Q96RV3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCNX1Q96RV3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCNX1Q96RV3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCNX1Q96RV3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCNX1Q96RV3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCNX1Q96RV3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCNX1Q96RV3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCNX1Q96RV3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCNX1Q96RV3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCNX1Q96RV3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCNX1Q96RV3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCNX1Q96RV3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCNX1Q96RV3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCNX1Q96RV3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCNX1Q96RV3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCNX1Q96RV3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCNX1Q96RV3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCNX1Q96RV3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCNX1Q96RV3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCNX1Q96RV3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCNX1Q96RV3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCNX1Q96RV3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCNX1Q96RV3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PCNX1Q96RV3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCNX1Q96RV3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCNX1Q96RV3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCNX1Q96RV3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCNX1Q96RV3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCNX1Q96RV3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PCNX1Q96RV3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCNX1Q96RV3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCNX1Q96RV3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCNX1Q96RV3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCNX1Q96RV3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PCNX1Q96RV3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCNX1Q96RV3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCNX1Q96RV3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCNX1Q96RV3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCNX1Q96RV3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCNX1Q96RV3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCNX1Q96RV3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCNX1Q96RV3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCNX1Q96RV3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCNX1Q96RV3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCNX1Q96RV3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCNX1Q96RV3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCNX1Q96RV3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCNX1Q96RV3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCNX1Q96RV3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCNX1Q96RV3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCNX1Q96RV3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PCNX1Q96RV3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCNX1Q96RV3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCNX1Q96RV3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCNX1Q96RV3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCNX1Q96RV3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCNX1Q96RV3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCNX1Q96RV3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCNX1Q96RV3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCNX1Q96RV3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCNX1Q96RV3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCNX1Q96RV3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PCNX1Q96RV3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PCNX1Q96RV3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCNX1Q96RV3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCNX1Q96RV3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCNX1Q96RV3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCNX1Q96RV3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PCNX1Q96RV3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCNX1Q96RV3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCNX1Q96RV3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCNX1Q96RV3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCNX1Q96RV3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCNX1Q96RV3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCNX1Q96RV3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCNX1Q96RV3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCNX1Q96RV3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms