Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK4

BBS4, Bardet-Biedl syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS4Q96RK4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BBS4Q96RK4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BBS4Q96RK4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BBS4Q96RK4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BBS4Q96RK4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BBS4Q96RK4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BBS4Q96RK4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BBS4Q96RK4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BBS4Q96RK4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BBS4Q96RK4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BBS4Q96RK4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BBS4Q96RK4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BBS4Q96RK4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BBS4Q96RK4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BBS4Q96RK4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BBS4Q96RK4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BBS4Q96RK4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BBS4Q96RK4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BBS4Q96RK4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BBS4Q96RK4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BBS4Q96RK4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BBS4Q96RK4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BBS4Q96RK4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
BBS4Q96RK4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BBS4Q96RK4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BBS4Q96RK4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BBS4Q96RK4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BBS4Q96RK4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BBS4Q96RK4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BBS4Q96RK4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BBS4Q96RK4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
BBS4Q96RK4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BBS4Q96RK4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BBS4Q96RK4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BBS4Q96RK4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BBS4Q96RK4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BBS4Q96RK4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BBS4Q96RK4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BBS4Q96RK4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BBS4Q96RK4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BBS4Q96RK4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
BBS4Q96RK4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BBS4Q96RK4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BBS4Q96RK4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BBS4Q96RK4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BBS4Q96RK4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BBS4Q96RK4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BBS4Q96RK4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BBS4Q96RK4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BBS4Q96RK4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BBS4Q96RK4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BBS4Q96RK4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BBS4Q96RK4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BBS4Q96RK4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BBS4Q96RK4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BBS4Q96RK4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BBS4Q96RK4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BBS4Q96RK4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BBS4Q96RK4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BBS4Q96RK4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BBS4Q96RK4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BBS4Q96RK4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BBS4Q96RK4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BBS4Q96RK4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BBS4Q96RK4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BBS4Q96RK4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BBS4Q96RK4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BBS4Q96RK4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BBS4Q96RK4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BBS4Q96RK4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BBS4Q96RK4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BBS4Q96RK4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BBS4Q96RK4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BBS4Q96RK4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BBS4Q96RK4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BBS4Q96RK4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BBS4Q96RK4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BBS4Q96RK4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BBS4Q96RK4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BBS4Q96RK4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BBS4Q96RK4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BBS4Q96RK4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BBS4Q96RK4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BBS4Q96RK4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BBS4Q96RK4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BBS4Q96RK4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BBS4Q96RK4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BBS4Q96RK4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BBS4Q96RK4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BBS4Q96RK4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BBS4Q96RK4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BBS4Q96RK4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BBS4Q96RK4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BBS4Q96RK4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BBS4Q96RK4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BBS4Q96RK4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BBS4Q96RK4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BBS4Q96RK4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BBS4Q96RK4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BBS4Q96RK4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms