Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHF12Q96QT6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHF12Q96QT6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHF12Q96QT6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHF12Q96QT6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHF12Q96QT6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PHF12Q96QT6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHF12Q96QT6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHF12Q96QT6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHF12Q96QT6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHF12Q96QT6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHF12Q96QT6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHF12Q96QT6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHF12Q96QT6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHF12Q96QT6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHF12Q96QT6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHF12Q96QT6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHF12Q96QT6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHF12Q96QT6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHF12Q96QT6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHF12Q96QT6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHF12Q96QT6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHF12Q96QT6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHF12Q96QT6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHF12Q96QT6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHF12Q96QT6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHF12Q96QT6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHF12Q96QT6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHF12Q96QT6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHF12Q96QT6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHF12Q96QT6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHF12Q96QT6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHF12Q96QT6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHF12Q96QT6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHF12Q96QT6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHF12Q96QT6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PHF12Q96QT6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHF12Q96QT6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHF12Q96QT6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHF12Q96QT6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHF12Q96QT6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHF12Q96QT6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHF12Q96QT6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHF12Q96QT6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHF12Q96QT6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHF12Q96QT6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHF12Q96QT6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHF12Q96QT6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHF12Q96QT6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHF12Q96QT6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHF12Q96QT6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHF12Q96QT6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHF12Q96QT6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHF12Q96QT6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHF12Q96QT6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHF12Q96QT6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHF12Q96QT6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHF12Q96QT6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHF12Q96QT6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHF12Q96QT6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHF12Q96QT6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHF12Q96QT6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHF12Q96QT6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PHF12Q96QT6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHF12Q96QT6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHF12Q96QT6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHF12Q96QT6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHF12Q96QT6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHF12Q96QT6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHF12Q96QT6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PHF12Q96QT6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PHF12Q96QT6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF12Q96QT6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF12Q96QT6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF12Q96QT6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHF12Q96QT6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PHF12Q96QT6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHF12Q96QT6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHF12Q96QT6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHF12Q96QT6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHF12Q96QT6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHF12Q96QT6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PHF12Q96QT6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PHF12Q96QT6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHF12Q96QT6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PHF12Q96QT6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHF12Q96QT6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PHF12Q96QT6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PHF12Q96QT6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHF12Q96QT6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PHF12Q96QT6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHF12Q96QT6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHF12Q96QT6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHF12Q96QT6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PHF12Q96QT6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHF12Q96QT6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PHF12Q96QT6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHF12Q96QT6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PHF12Q96QT6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PHF12Q96QT6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms