Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q06

PLIN4, Perilipin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN4Q96Q06 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PLIN4Q96Q06 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PLIN4Q96Q06 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
PLIN4Q96Q06 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
PLIN4Q96Q06 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PLIN4Q96Q06 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
PLIN4Q96Q06 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PLIN4Q96Q06 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PLIN4Q96Q06 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PLIN4Q96Q06 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PLIN4Q96Q06 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PLIN4Q96Q06 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
PLIN4Q96Q06 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
PLIN4Q96Q06 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PLIN4Q96Q06 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PLIN4Q96Q06 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PLIN4Q96Q06 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PLIN4Q96Q06 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
PLIN4Q96Q06 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
PLIN4Q96Q06 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PLIN4Q96Q06 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PLIN4Q96Q06 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PLIN4Q96Q06 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PLIN4Q96Q06 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PLIN4Q96Q06 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PLIN4Q96Q06 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PLIN4Q96Q06 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PLIN4Q96Q06 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PLIN4Q96Q06 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PLIN4Q96Q06 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PLIN4Q96Q06 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PLIN4Q96Q06 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PLIN4Q96Q06 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
PLIN4Q96Q06 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PLIN4Q96Q06 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PLIN4Q96Q06 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
PLIN4Q96Q06 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PLIN4Q96Q06 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PLIN4Q96Q06 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PLIN4Q96Q06 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PLIN4Q96Q06 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
PLIN4Q96Q06 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PLIN4Q96Q06 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PLIN4Q96Q06 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PLIN4Q96Q06 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PLIN4Q96Q06 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PLIN4Q96Q06 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
PLIN4Q96Q06 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PLIN4Q96Q06 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PLIN4Q96Q06 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PLIN4Q96Q06 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PLIN4Q96Q06 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PLIN4Q96Q06 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PLIN4Q96Q06 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PLIN4Q96Q06 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PLIN4Q96Q06 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PLIN4Q96Q06 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PLIN4Q96Q06 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PLIN4Q96Q06 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PLIN4Q96Q06 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PLIN4Q96Q06 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PLIN4Q96Q06 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PLIN4Q96Q06 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PLIN4Q96Q06 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PLIN4Q96Q06 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PLIN4Q96Q06 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PLIN4Q96Q06 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PLIN4Q96Q06 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PLIN4Q96Q06 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PLIN4Q96Q06 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PLIN4Q96Q06 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PLIN4Q96Q06 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PLIN4Q96Q06 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PLIN4Q96Q06 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PLIN4Q96Q06 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PLIN4Q96Q06 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PLIN4Q96Q06 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
PLIN4Q96Q06 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PLIN4Q96Q06 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PLIN4Q96Q06 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PLIN4Q96Q06 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PLIN4Q96Q06 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PLIN4Q96Q06 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PLIN4Q96Q06 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PLIN4Q96Q06 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PLIN4Q96Q06 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PLIN4Q96Q06 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PLIN4Q96Q06 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PLIN4Q96Q06 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PLIN4Q96Q06 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
PLIN4Q96Q06 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PLIN4Q96Q06 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PLIN4Q96Q06 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PLIN4Q96Q06 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PLIN4Q96Q06 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PLIN4Q96Q06 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PLIN4Q96Q06 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PLIN4Q96Q06 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PLIN4Q96Q06 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PLIN4Q96Q06 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms