Protein–RNA interactions for Protein: Q96P48

ARAP1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAP1Q96P48 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
ARAP1Q96P48 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
ARAP1Q96P48 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
ARAP1Q96P48 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
ARAP1Q96P48 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC45.49■■■■■ 4.87
ARAP1Q96P48 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC45.48■■■■■ 4.87
ARAP1Q96P48 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.47■■■■■ 4.87
ARAP1Q96P48 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC45.42■■■■■ 4.86
ARAP1Q96P48 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
ARAP1Q96P48 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
ARAP1Q96P48 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC45.4■■■■■ 4.86
ARAP1Q96P48 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.39■■■■■ 4.86
ARAP1Q96P48 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.38■■■■■ 4.86
ARAP1Q96P48 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.36■■■■■ 4.85
ARAP1Q96P48 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
ARAP1Q96P48 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
ARAP1Q96P48 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC45.3■■■■■ 4.84
ARAP1Q96P48 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
ARAP1Q96P48 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC45.29■■■■■ 4.84
ARAP1Q96P48 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
ARAP1Q96P48 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
ARAP1Q96P48 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.26■■■■■ 4.84
ARAP1Q96P48 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC45.26■■■■■ 4.84
ARAP1Q96P48 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC45.24■■■■■ 4.83
ARAP1Q96P48 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC45.23■■■■■ 4.83
ARAP1Q96P48 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC45.21■■■■■ 4.83
ARAP1Q96P48 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC45.21■■■■■ 4.83
ARAP1Q96P48 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC45.21■■■■■ 4.83
ARAP1Q96P48 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
ARAP1Q96P48 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC45.2■■■■■ 4.83
ARAP1Q96P48 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC45.2■■■■■ 4.83
ARAP1Q96P48 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
ARAP1Q96P48 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
ARAP1Q96P48 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC45.17■■■■■ 4.82
ARAP1Q96P48 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC45.17■■■■■ 4.82
ARAP1Q96P48 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
ARAP1Q96P48 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC45.16■■■■■ 4.82
ARAP1Q96P48 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
ARAP1Q96P48 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC45.12■■■■■ 4.81
ARAP1Q96P48 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC45.12■■■■■ 4.81
ARAP1Q96P48 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.12■■■■■ 4.81
ARAP1Q96P48 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
ARAP1Q96P48 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC45.11■■■■■ 4.81
ARAP1Q96P48 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC45.11■■■■■ 4.81
ARAP1Q96P48 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
ARAP1Q96P48 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
ARAP1Q96P48 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
ARAP1Q96P48 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
ARAP1Q96P48 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
ARAP1Q96P48 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
ARAP1Q96P48 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC45.04■■■■■ 4.8
ARAP1Q96P48 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC45.04■■■■■ 4.8
ARAP1Q96P48 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC45.03■■■■■ 4.8
ARAP1Q96P48 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC45.02■■■■■ 4.8
ARAP1Q96P48 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC45.02■■■■■ 4.8
ARAP1Q96P48 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
ARAP1Q96P48 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
ARAP1Q96P48 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC45.01■■■■■ 4.8
ARAP1Q96P48 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC45.01■■■■■ 4.8
ARAP1Q96P48 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
ARAP1Q96P48 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45■■■■■ 4.79
ARAP1Q96P48 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
ARAP1Q96P48 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC44.96■■■■■ 4.79
ARAP1Q96P48 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.93■■■■■ 4.78
ARAP1Q96P48 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
ARAP1Q96P48 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC44.9■■■■■ 4.78
ARAP1Q96P48 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC44.9■■■■■ 4.78
ARAP1Q96P48 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC44.89■■■■■ 4.78
ARAP1Q96P48 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
ARAP1Q96P48 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
ARAP1Q96P48 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC44.88■■■■■ 4.78
ARAP1Q96P48 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.87■■■■■ 4.77
ARAP1Q96P48 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
ARAP1Q96P48 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
ARAP1Q96P48 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
ARAP1Q96P48 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC44.83■■■■■ 4.77
ARAP1Q96P48 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.82■■■■■ 4.77
ARAP1Q96P48 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
ARAP1Q96P48 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.82■■■■■ 4.77
ARAP1Q96P48 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC44.8■■■■■ 4.76
ARAP1Q96P48 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC44.8■■■■■ 4.76
ARAP1Q96P48 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
ARAP1Q96P48 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC44.77■■■■■ 4.76
ARAP1Q96P48 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC44.77■■■■■ 4.76
ARAP1Q96P48 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC44.74■■■■■ 4.75
ARAP1Q96P48 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
ARAP1Q96P48 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
ARAP1Q96P48 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
ARAP1Q96P48 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
ARAP1Q96P48 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
ARAP1Q96P48 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC44.72■■■■■ 4.75
ARAP1Q96P48 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
ARAP1Q96P48 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
ARAP1Q96P48 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
ARAP1Q96P48 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC44.69■■■■■ 4.74
ARAP1Q96P48 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC44.69■■■■■ 4.74
ARAP1Q96P48 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC44.69■■■■■ 4.74
ARAP1Q96P48 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
ARAP1Q96P48 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC44.65■■■■■ 4.74
ARAP1Q96P48 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms