Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT5

SLC46A1, Proton-coupled folate transporter, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A1Q96NT5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC46A1Q96NT5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC46A1Q96NT5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC46A1Q96NT5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC46A1Q96NT5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC46A1Q96NT5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC46A1Q96NT5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC46A1Q96NT5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC46A1Q96NT5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC46A1Q96NT5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC46A1Q96NT5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC46A1Q96NT5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC46A1Q96NT5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC46A1Q96NT5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC46A1Q96NT5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC46A1Q96NT5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC46A1Q96NT5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC46A1Q96NT5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC46A1Q96NT5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC46A1Q96NT5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC46A1Q96NT5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC46A1Q96NT5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC46A1Q96NT5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC46A1Q96NT5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC46A1Q96NT5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC46A1Q96NT5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC46A1Q96NT5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC46A1Q96NT5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC46A1Q96NT5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC46A1Q96NT5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC46A1Q96NT5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC46A1Q96NT5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC46A1Q96NT5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC46A1Q96NT5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC46A1Q96NT5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC46A1Q96NT5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC46A1Q96NT5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC46A1Q96NT5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC46A1Q96NT5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC46A1Q96NT5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC46A1Q96NT5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC46A1Q96NT5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC46A1Q96NT5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC46A1Q96NT5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC46A1Q96NT5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC46A1Q96NT5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC46A1Q96NT5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC46A1Q96NT5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC46A1Q96NT5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC46A1Q96NT5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC46A1Q96NT5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC46A1Q96NT5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC46A1Q96NT5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC46A1Q96NT5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC46A1Q96NT5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC46A1Q96NT5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC46A1Q96NT5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC46A1Q96NT5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC46A1Q96NT5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC46A1Q96NT5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC46A1Q96NT5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC46A1Q96NT5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC46A1Q96NT5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC46A1Q96NT5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC46A1Q96NT5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC46A1Q96NT5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC46A1Q96NT5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC46A1Q96NT5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC46A1Q96NT5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC46A1Q96NT5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC46A1Q96NT5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC46A1Q96NT5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC46A1Q96NT5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC46A1Q96NT5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC46A1Q96NT5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC46A1Q96NT5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC46A1Q96NT5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC46A1Q96NT5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC46A1Q96NT5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC46A1Q96NT5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC46A1Q96NT5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC46A1Q96NT5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC46A1Q96NT5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC46A1Q96NT5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC46A1Q96NT5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC46A1Q96NT5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC46A1Q96NT5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC46A1Q96NT5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC46A1Q96NT5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC46A1Q96NT5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC46A1Q96NT5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC46A1Q96NT5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC46A1Q96NT5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC46A1Q96NT5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC46A1Q96NT5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC46A1Q96NT5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC46A1Q96NT5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC46A1Q96NT5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC46A1Q96NT5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC46A1Q96NT5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms