Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC115Q96NT0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC115Q96NT0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC115Q96NT0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC115Q96NT0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC115Q96NT0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC115Q96NT0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC115Q96NT0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC115Q96NT0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC115Q96NT0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC115Q96NT0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC115Q96NT0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC115Q96NT0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC115Q96NT0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC115Q96NT0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC115Q96NT0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC115Q96NT0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC115Q96NT0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC115Q96NT0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC115Q96NT0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC115Q96NT0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC115Q96NT0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC115Q96NT0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC115Q96NT0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC115Q96NT0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC115Q96NT0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC115Q96NT0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC115Q96NT0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC115Q96NT0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC115Q96NT0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC115Q96NT0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC115Q96NT0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC115Q96NT0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC115Q96NT0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC115Q96NT0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC115Q96NT0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC115Q96NT0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC115Q96NT0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC115Q96NT0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC115Q96NT0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC115Q96NT0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC115Q96NT0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC115Q96NT0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC115Q96NT0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC115Q96NT0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC115Q96NT0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC115Q96NT0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC115Q96NT0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC115Q96NT0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC115Q96NT0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC115Q96NT0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC115Q96NT0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC115Q96NT0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC115Q96NT0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC115Q96NT0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC115Q96NT0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC115Q96NT0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC115Q96NT0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC115Q96NT0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC115Q96NT0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC115Q96NT0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC115Q96NT0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC115Q96NT0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC115Q96NT0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC115Q96NT0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC115Q96NT0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC115Q96NT0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC115Q96NT0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC115Q96NT0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC115Q96NT0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC115Q96NT0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC115Q96NT0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC115Q96NT0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC115Q96NT0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC115Q96NT0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC115Q96NT0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC115Q96NT0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC115Q96NT0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC115Q96NT0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC115Q96NT0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC115Q96NT0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC115Q96NT0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC115Q96NT0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC115Q96NT0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC115Q96NT0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC115Q96NT0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC115Q96NT0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC115Q96NT0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC115Q96NT0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC115Q96NT0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC115Q96NT0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC115Q96NT0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC115Q96NT0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC115Q96NT0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC115Q96NT0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC115Q96NT0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC115Q96NT0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC115Q96NT0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC115Q96NT0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC115Q96NT0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms