Protein–RNA interactions for Protein: Q96NJ1

Uncharacterized protein FLJ30774, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q96NJ1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q96NJ1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q96NJ1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q96NJ1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q96NJ1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q96NJ1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q96NJ1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q96NJ1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q96NJ1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q96NJ1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q96NJ1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q96NJ1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q96NJ1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q96NJ1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q96NJ1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q96NJ1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q96NJ1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q96NJ1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q96NJ1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q96NJ1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q96NJ1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q96NJ1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q96NJ1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q96NJ1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q96NJ1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q96NJ1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q96NJ1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q96NJ1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q96NJ1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q96NJ1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q96NJ1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q96NJ1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q96NJ1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q96NJ1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q96NJ1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q96NJ1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q96NJ1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q96NJ1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q96NJ1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q96NJ1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q96NJ1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q96NJ1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q96NJ1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q96NJ1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q96NJ1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q96NJ1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q96NJ1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q96NJ1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q96NJ1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q96NJ1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q96NJ1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q96NJ1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q96NJ1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q96NJ1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q96NJ1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q96NJ1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q96NJ1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q96NJ1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q96NJ1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q96NJ1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q96NJ1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q96NJ1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q96NJ1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q96NJ1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q96NJ1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q96NJ1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q96NJ1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q96NJ1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q96NJ1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q96NJ1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q96NJ1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q96NJ1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q96NJ1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q96NJ1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q96NJ1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q96NJ1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q96NJ1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q96NJ1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q96NJ1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q96NJ1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q96NJ1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q96NJ1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q96NJ1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q96NJ1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q96NJ1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q96NJ1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q96NJ1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q96NJ1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q96NJ1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q96NJ1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q96NJ1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q96NJ1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q96NJ1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q96NJ1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q96NJ1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q96NJ1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q96NJ1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q96NJ1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q96NJ1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q96NJ1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms