Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG7

NSMCE3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE3Q96MG7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NSMCE3Q96MG7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NSMCE3Q96MG7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NSMCE3Q96MG7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NSMCE3Q96MG7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NSMCE3Q96MG7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
NSMCE3Q96MG7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NSMCE3Q96MG7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NSMCE3Q96MG7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NSMCE3Q96MG7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NSMCE3Q96MG7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NSMCE3Q96MG7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NSMCE3Q96MG7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NSMCE3Q96MG7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NSMCE3Q96MG7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NSMCE3Q96MG7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NSMCE3Q96MG7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NSMCE3Q96MG7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NSMCE3Q96MG7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NSMCE3Q96MG7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NSMCE3Q96MG7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NSMCE3Q96MG7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NSMCE3Q96MG7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NSMCE3Q96MG7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NSMCE3Q96MG7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NSMCE3Q96MG7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NSMCE3Q96MG7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NSMCE3Q96MG7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NSMCE3Q96MG7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NSMCE3Q96MG7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NSMCE3Q96MG7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NSMCE3Q96MG7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NSMCE3Q96MG7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NSMCE3Q96MG7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NSMCE3Q96MG7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NSMCE3Q96MG7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NSMCE3Q96MG7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NSMCE3Q96MG7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NSMCE3Q96MG7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NSMCE3Q96MG7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NSMCE3Q96MG7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NSMCE3Q96MG7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NSMCE3Q96MG7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NSMCE3Q96MG7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NSMCE3Q96MG7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NSMCE3Q96MG7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NSMCE3Q96MG7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NSMCE3Q96MG7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NSMCE3Q96MG7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NSMCE3Q96MG7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NSMCE3Q96MG7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NSMCE3Q96MG7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NSMCE3Q96MG7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NSMCE3Q96MG7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NSMCE3Q96MG7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NSMCE3Q96MG7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NSMCE3Q96MG7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NSMCE3Q96MG7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NSMCE3Q96MG7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NSMCE3Q96MG7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NSMCE3Q96MG7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NSMCE3Q96MG7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NSMCE3Q96MG7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NSMCE3Q96MG7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NSMCE3Q96MG7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NSMCE3Q96MG7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NSMCE3Q96MG7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NSMCE3Q96MG7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NSMCE3Q96MG7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NSMCE3Q96MG7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NSMCE3Q96MG7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NSMCE3Q96MG7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NSMCE3Q96MG7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NSMCE3Q96MG7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NSMCE3Q96MG7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NSMCE3Q96MG7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NSMCE3Q96MG7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NSMCE3Q96MG7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NSMCE3Q96MG7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NSMCE3Q96MG7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NSMCE3Q96MG7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NSMCE3Q96MG7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NSMCE3Q96MG7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NSMCE3Q96MG7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NSMCE3Q96MG7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NSMCE3Q96MG7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NSMCE3Q96MG7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NSMCE3Q96MG7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NSMCE3Q96MG7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NSMCE3Q96MG7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NSMCE3Q96MG7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NSMCE3Q96MG7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NSMCE3Q96MG7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NSMCE3Q96MG7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSMCE3Q96MG7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSMCE3Q96MG7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NSMCE3Q96MG7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NSMCE3Q96MG7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSMCE3Q96MG7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NSMCE3Q96MG7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms