Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC114Q96M63 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC114Q96M63 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC114Q96M63 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC114Q96M63 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC114Q96M63 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC114Q96M63 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC114Q96M63 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC114Q96M63 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC114Q96M63 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC114Q96M63 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC114Q96M63 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC114Q96M63 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC114Q96M63 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC114Q96M63 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC114Q96M63 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC114Q96M63 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC114Q96M63 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC114Q96M63 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC114Q96M63 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC114Q96M63 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC114Q96M63 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC114Q96M63 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC114Q96M63 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC114Q96M63 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC114Q96M63 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC114Q96M63 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC114Q96M63 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC114Q96M63 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC114Q96M63 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC114Q96M63 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC114Q96M63 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC114Q96M63 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC114Q96M63 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC114Q96M63 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC114Q96M63 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC114Q96M63 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC114Q96M63 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC114Q96M63 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC114Q96M63 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC114Q96M63 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC114Q96M63 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC114Q96M63 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC114Q96M63 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC114Q96M63 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC114Q96M63 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC114Q96M63 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC114Q96M63 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CCDC114Q96M63 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC114Q96M63 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC114Q96M63 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC114Q96M63 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC114Q96M63 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC114Q96M63 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC114Q96M63 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC114Q96M63 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC114Q96M63 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC114Q96M63 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC114Q96M63 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC114Q96M63 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC114Q96M63 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC114Q96M63 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC114Q96M63 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC114Q96M63 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC114Q96M63 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC114Q96M63 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC114Q96M63 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC114Q96M63 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC114Q96M63 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC114Q96M63 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC114Q96M63 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC114Q96M63 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC114Q96M63 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC114Q96M63 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC114Q96M63 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC114Q96M63 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC114Q96M63 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC114Q96M63 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC114Q96M63 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC114Q96M63 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC114Q96M63 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC114Q96M63 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC114Q96M63 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC114Q96M63 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC114Q96M63 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC114Q96M63 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC114Q96M63 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC114Q96M63 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC114Q96M63 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC114Q96M63 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC114Q96M63 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC114Q96M63 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC114Q96M63 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC114Q96M63 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC114Q96M63 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC114Q96M63 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC114Q96M63 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC114Q96M63 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC114Q96M63 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC114Q96M63 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms