Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
USP47Q96K76 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
USP47Q96K76 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
USP47Q96K76 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
USP47Q96K76 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
USP47Q96K76 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
USP47Q96K76 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
USP47Q96K76 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
USP47Q96K76 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
USP47Q96K76 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
USP47Q96K76 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
USP47Q96K76 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
USP47Q96K76 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
USP47Q96K76 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
USP47Q96K76 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
USP47Q96K76 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
USP47Q96K76 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
USP47Q96K76 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
USP47Q96K76 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
USP47Q96K76 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
USP47Q96K76 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
USP47Q96K76 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
USP47Q96K76 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
USP47Q96K76 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
USP47Q96K76 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
USP47Q96K76 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
USP47Q96K76 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
USP47Q96K76 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
USP47Q96K76 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
USP47Q96K76 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC38.23■■■■□ 3.71
USP47Q96K76 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
USP47Q96K76 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
USP47Q96K76 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
USP47Q96K76 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
USP47Q96K76 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
USP47Q96K76 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC38.18■■■■□ 3.7
USP47Q96K76 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
USP47Q96K76 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
USP47Q96K76 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
USP47Q96K76 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
USP47Q96K76 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
USP47Q96K76 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
USP47Q96K76 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
USP47Q96K76 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
USP47Q96K76 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
USP47Q96K76 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC38.04■■■■□ 3.68
USP47Q96K76 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
USP47Q96K76 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
USP47Q96K76 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.67
USP47Q96K76 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
USP47Q96K76 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
USP47Q96K76 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
USP47Q96K76 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
USP47Q96K76 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
USP47Q96K76 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
USP47Q96K76 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
USP47Q96K76 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
USP47Q96K76 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
USP47Q96K76 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
USP47Q96K76 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
USP47Q96K76 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
USP47Q96K76 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
USP47Q96K76 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
USP47Q96K76 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
USP47Q96K76 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
USP47Q96K76 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
USP47Q96K76 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
USP47Q96K76 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
USP47Q96K76 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC37.86■■■■□ 3.65
USP47Q96K76 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
USP47Q96K76 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
USP47Q96K76 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
USP47Q96K76 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
USP47Q96K76 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.65
USP47Q96K76 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
USP47Q96K76 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
USP47Q96K76 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
USP47Q96K76 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
USP47Q96K76 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
USP47Q96K76 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
USP47Q96K76 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
USP47Q96K76 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
USP47Q96K76 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
USP47Q96K76 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC37.8■■■■□ 3.64
USP47Q96K76 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
USP47Q96K76 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
USP47Q96K76 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
USP47Q96K76 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
USP47Q96K76 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
USP47Q96K76 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
USP47Q96K76 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
USP47Q96K76 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
USP47Q96K76 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
USP47Q96K76 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
USP47Q96K76 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
USP47Q96K76 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
USP47Q96K76 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
USP47Q96K76 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
USP47Q96K76 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
USP47Q96K76 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.5 ms