Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PGBD1Q96JS3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PGBD1Q96JS3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PGBD1Q96JS3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PGBD1Q96JS3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PGBD1Q96JS3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PGBD1Q96JS3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PGBD1Q96JS3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
PGBD1Q96JS3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PGBD1Q96JS3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
PGBD1Q96JS3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PGBD1Q96JS3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PGBD1Q96JS3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
PGBD1Q96JS3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PGBD1Q96JS3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PGBD1Q96JS3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PGBD1Q96JS3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PGBD1Q96JS3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PGBD1Q96JS3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
PGBD1Q96JS3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PGBD1Q96JS3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PGBD1Q96JS3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PGBD1Q96JS3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PGBD1Q96JS3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PGBD1Q96JS3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PGBD1Q96JS3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PGBD1Q96JS3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PGBD1Q96JS3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PGBD1Q96JS3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PGBD1Q96JS3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PGBD1Q96JS3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PGBD1Q96JS3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PGBD1Q96JS3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PGBD1Q96JS3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PGBD1Q96JS3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
PGBD1Q96JS3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PGBD1Q96JS3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PGBD1Q96JS3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PGBD1Q96JS3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PGBD1Q96JS3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PGBD1Q96JS3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PGBD1Q96JS3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PGBD1Q96JS3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PGBD1Q96JS3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PGBD1Q96JS3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PGBD1Q96JS3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PGBD1Q96JS3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PGBD1Q96JS3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
PGBD1Q96JS3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PGBD1Q96JS3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PGBD1Q96JS3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
PGBD1Q96JS3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PGBD1Q96JS3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PGBD1Q96JS3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PGBD1Q96JS3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PGBD1Q96JS3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PGBD1Q96JS3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PGBD1Q96JS3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
PGBD1Q96JS3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PGBD1Q96JS3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PGBD1Q96JS3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PGBD1Q96JS3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
PGBD1Q96JS3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PGBD1Q96JS3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PGBD1Q96JS3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
PGBD1Q96JS3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PGBD1Q96JS3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PGBD1Q96JS3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PGBD1Q96JS3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PGBD1Q96JS3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PGBD1Q96JS3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PGBD1Q96JS3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PGBD1Q96JS3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PGBD1Q96JS3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PGBD1Q96JS3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PGBD1Q96JS3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PGBD1Q96JS3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PGBD1Q96JS3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PGBD1Q96JS3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PGBD1Q96JS3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PGBD1Q96JS3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PGBD1Q96JS3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PGBD1Q96JS3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PGBD1Q96JS3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PGBD1Q96JS3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PGBD1Q96JS3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PGBD1Q96JS3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
PGBD1Q96JS3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PGBD1Q96JS3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PGBD1Q96JS3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PGBD1Q96JS3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PGBD1Q96JS3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PGBD1Q96JS3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PGBD1Q96JS3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PGBD1Q96JS3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PGBD1Q96JS3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
PGBD1Q96JS3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PGBD1Q96JS3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PGBD1Q96JS3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PGBD1Q96JS3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms