Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CCDC136Q96JN2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CCDC136Q96JN2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CCDC136Q96JN2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CCDC136Q96JN2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CCDC136Q96JN2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CCDC136Q96JN2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CCDC136Q96JN2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CCDC136Q96JN2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CCDC136Q96JN2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CCDC136Q96JN2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CCDC136Q96JN2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CCDC136Q96JN2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CCDC136Q96JN2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CCDC136Q96JN2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CCDC136Q96JN2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CCDC136Q96JN2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CCDC136Q96JN2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CCDC136Q96JN2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CCDC136Q96JN2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CCDC136Q96JN2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CCDC136Q96JN2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CCDC136Q96JN2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CCDC136Q96JN2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CCDC136Q96JN2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CCDC136Q96JN2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CCDC136Q96JN2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CCDC136Q96JN2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CCDC136Q96JN2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CCDC136Q96JN2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CCDC136Q96JN2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CCDC136Q96JN2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CCDC136Q96JN2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CCDC136Q96JN2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CCDC136Q96JN2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CCDC136Q96JN2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
CCDC136Q96JN2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CCDC136Q96JN2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CCDC136Q96JN2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CCDC136Q96JN2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CCDC136Q96JN2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CCDC136Q96JN2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CCDC136Q96JN2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CCDC136Q96JN2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CCDC136Q96JN2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
CCDC136Q96JN2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CCDC136Q96JN2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CCDC136Q96JN2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC136Q96JN2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC136Q96JN2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC136Q96JN2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CCDC136Q96JN2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CCDC136Q96JN2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CCDC136Q96JN2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CCDC136Q96JN2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCDC136Q96JN2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
CCDC136Q96JN2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CCDC136Q96JN2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CCDC136Q96JN2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CCDC136Q96JN2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CCDC136Q96JN2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CCDC136Q96JN2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC136Q96JN2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC136Q96JN2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CCDC136Q96JN2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CCDC136Q96JN2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CCDC136Q96JN2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CCDC136Q96JN2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
CCDC136Q96JN2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CCDC136Q96JN2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CCDC136Q96JN2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCDC136Q96JN2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CCDC136Q96JN2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CCDC136Q96JN2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CCDC136Q96JN2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CCDC136Q96JN2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC136Q96JN2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC136Q96JN2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CCDC136Q96JN2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CCDC136Q96JN2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CCDC136Q96JN2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC136Q96JN2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CCDC136Q96JN2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CCDC136Q96JN2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CCDC136Q96JN2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCDC136Q96JN2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCDC136Q96JN2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCDC136Q96JN2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CCDC136Q96JN2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CCDC136Q96JN2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CCDC136Q96JN2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CCDC136Q96JN2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCDC136Q96JN2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCDC136Q96JN2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CCDC136Q96JN2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CCDC136Q96JN2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CCDC136Q96JN2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CCDC136Q96JN2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCDC136Q96JN2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CCDC136Q96JN2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms