Protein–RNA interactions for Protein: Q96IC2

REXO5, RNA exonuclease 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 774 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO5Q96IC2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
REXO5Q96IC2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
REXO5Q96IC2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
REXO5Q96IC2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
REXO5Q96IC2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
REXO5Q96IC2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
REXO5Q96IC2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
REXO5Q96IC2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
REXO5Q96IC2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
REXO5Q96IC2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
REXO5Q96IC2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
REXO5Q96IC2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
REXO5Q96IC2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
REXO5Q96IC2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
REXO5Q96IC2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
REXO5Q96IC2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
REXO5Q96IC2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
REXO5Q96IC2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
REXO5Q96IC2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
REXO5Q96IC2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
REXO5Q96IC2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
REXO5Q96IC2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
REXO5Q96IC2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
REXO5Q96IC2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
REXO5Q96IC2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
REXO5Q96IC2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
REXO5Q96IC2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
REXO5Q96IC2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
REXO5Q96IC2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
REXO5Q96IC2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
REXO5Q96IC2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
REXO5Q96IC2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
REXO5Q96IC2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
REXO5Q96IC2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
REXO5Q96IC2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
REXO5Q96IC2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
REXO5Q96IC2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
REXO5Q96IC2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
REXO5Q96IC2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
REXO5Q96IC2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
REXO5Q96IC2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
REXO5Q96IC2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
REXO5Q96IC2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
REXO5Q96IC2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
REXO5Q96IC2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
REXO5Q96IC2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
REXO5Q96IC2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
REXO5Q96IC2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
REXO5Q96IC2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
REXO5Q96IC2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
REXO5Q96IC2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
REXO5Q96IC2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
REXO5Q96IC2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
REXO5Q96IC2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
REXO5Q96IC2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
REXO5Q96IC2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
REXO5Q96IC2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
REXO5Q96IC2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
REXO5Q96IC2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
REXO5Q96IC2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
REXO5Q96IC2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
REXO5Q96IC2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
REXO5Q96IC2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
REXO5Q96IC2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
REXO5Q96IC2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
REXO5Q96IC2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
REXO5Q96IC2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
REXO5Q96IC2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
REXO5Q96IC2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
REXO5Q96IC2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
REXO5Q96IC2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
REXO5Q96IC2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
REXO5Q96IC2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
REXO5Q96IC2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
REXO5Q96IC2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
REXO5Q96IC2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
REXO5Q96IC2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
REXO5Q96IC2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
REXO5Q96IC2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
REXO5Q96IC2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
REXO5Q96IC2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
REXO5Q96IC2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
REXO5Q96IC2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
REXO5Q96IC2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
REXO5Q96IC2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
REXO5Q96IC2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
REXO5Q96IC2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
REXO5Q96IC2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
REXO5Q96IC2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
REXO5Q96IC2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
REXO5Q96IC2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
REXO5Q96IC2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
REXO5Q96IC2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
REXO5Q96IC2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
REXO5Q96IC2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
REXO5Q96IC2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
REXO5Q96IC2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
REXO5Q96IC2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
REXO5Q96IC2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
REXO5Q96IC2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms