Protein–RNA interactions for Protein: Q96HR3

MED30, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 30, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED30Q96HR3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MED30Q96HR3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MED30Q96HR3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MED30Q96HR3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MED30Q96HR3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MED30Q96HR3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MED30Q96HR3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MED30Q96HR3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MED30Q96HR3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MED30Q96HR3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MED30Q96HR3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MED30Q96HR3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED30Q96HR3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MED30Q96HR3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MED30Q96HR3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MED30Q96HR3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED30Q96HR3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED30Q96HR3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED30Q96HR3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED30Q96HR3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED30Q96HR3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED30Q96HR3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED30Q96HR3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED30Q96HR3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED30Q96HR3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED30Q96HR3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED30Q96HR3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED30Q96HR3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED30Q96HR3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED30Q96HR3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED30Q96HR3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED30Q96HR3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED30Q96HR3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED30Q96HR3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED30Q96HR3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED30Q96HR3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED30Q96HR3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED30Q96HR3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED30Q96HR3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED30Q96HR3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED30Q96HR3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED30Q96HR3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MED30Q96HR3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MED30Q96HR3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MED30Q96HR3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MED30Q96HR3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MED30Q96HR3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MED30Q96HR3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MED30Q96HR3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MED30Q96HR3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MED30Q96HR3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MED30Q96HR3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED30Q96HR3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED30Q96HR3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED30Q96HR3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED30Q96HR3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED30Q96HR3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED30Q96HR3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED30Q96HR3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED30Q96HR3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MED30Q96HR3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MED30Q96HR3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED30Q96HR3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED30Q96HR3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED30Q96HR3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED30Q96HR3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED30Q96HR3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED30Q96HR3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED30Q96HR3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED30Q96HR3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED30Q96HR3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED30Q96HR3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED30Q96HR3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MED30Q96HR3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MED30Q96HR3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MED30Q96HR3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED30Q96HR3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED30Q96HR3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED30Q96HR3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED30Q96HR3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED30Q96HR3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED30Q96HR3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED30Q96HR3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED30Q96HR3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED30Q96HR3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED30Q96HR3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED30Q96HR3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED30Q96HR3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED30Q96HR3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED30Q96HR3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED30Q96HR3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED30Q96HR3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED30Q96HR3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED30Q96HR3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED30Q96HR3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED30Q96HR3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED30Q96HR3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MED30Q96HR3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED30Q96HR3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED30Q96HR3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms