Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT7

ASIC4, Acid-sensing ion channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC4Q96FT7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ASIC4Q96FT7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ASIC4Q96FT7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ASIC4Q96FT7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ASIC4Q96FT7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ASIC4Q96FT7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ASIC4Q96FT7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ASIC4Q96FT7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ASIC4Q96FT7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ASIC4Q96FT7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ASIC4Q96FT7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ASIC4Q96FT7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ASIC4Q96FT7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ASIC4Q96FT7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ASIC4Q96FT7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ASIC4Q96FT7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ASIC4Q96FT7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ASIC4Q96FT7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ASIC4Q96FT7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
ASIC4Q96FT7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ASIC4Q96FT7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ASIC4Q96FT7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ASIC4Q96FT7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ASIC4Q96FT7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ASIC4Q96FT7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ASIC4Q96FT7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ASIC4Q96FT7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ASIC4Q96FT7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ASIC4Q96FT7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ASIC4Q96FT7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ASIC4Q96FT7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ASIC4Q96FT7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ASIC4Q96FT7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ASIC4Q96FT7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ASIC4Q96FT7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ASIC4Q96FT7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ASIC4Q96FT7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ASIC4Q96FT7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ASIC4Q96FT7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ASIC4Q96FT7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ASIC4Q96FT7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ASIC4Q96FT7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ASIC4Q96FT7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ASIC4Q96FT7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ASIC4Q96FT7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ASIC4Q96FT7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ASIC4Q96FT7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ASIC4Q96FT7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ASIC4Q96FT7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ASIC4Q96FT7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ASIC4Q96FT7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ASIC4Q96FT7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ASIC4Q96FT7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ASIC4Q96FT7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ASIC4Q96FT7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ASIC4Q96FT7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ASIC4Q96FT7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ASIC4Q96FT7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ASIC4Q96FT7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ASIC4Q96FT7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ASIC4Q96FT7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ASIC4Q96FT7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ASIC4Q96FT7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ASIC4Q96FT7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ASIC4Q96FT7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ASIC4Q96FT7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ASIC4Q96FT7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ASIC4Q96FT7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ASIC4Q96FT7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ASIC4Q96FT7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ASIC4Q96FT7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ASIC4Q96FT7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ASIC4Q96FT7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ASIC4Q96FT7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ASIC4Q96FT7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ASIC4Q96FT7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ASIC4Q96FT7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ASIC4Q96FT7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ASIC4Q96FT7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ASIC4Q96FT7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ASIC4Q96FT7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ASIC4Q96FT7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ASIC4Q96FT7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ASIC4Q96FT7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ASIC4Q96FT7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ASIC4Q96FT7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ASIC4Q96FT7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ASIC4Q96FT7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ASIC4Q96FT7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ASIC4Q96FT7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ASIC4Q96FT7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ASIC4Q96FT7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ASIC4Q96FT7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ASIC4Q96FT7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ASIC4Q96FT7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ASIC4Q96FT7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ASIC4Q96FT7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ASIC4Q96FT7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ASIC4Q96FT7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ASIC4Q96FT7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms