Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEIL1Q96FI4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEIL1Q96FI4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEIL1Q96FI4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEIL1Q96FI4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEIL1Q96FI4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEIL1Q96FI4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEIL1Q96FI4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEIL1Q96FI4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEIL1Q96FI4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEIL1Q96FI4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEIL1Q96FI4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEIL1Q96FI4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEIL1Q96FI4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEIL1Q96FI4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEIL1Q96FI4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEIL1Q96FI4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NEIL1Q96FI4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEIL1Q96FI4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEIL1Q96FI4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEIL1Q96FI4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEIL1Q96FI4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEIL1Q96FI4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEIL1Q96FI4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEIL1Q96FI4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEIL1Q96FI4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEIL1Q96FI4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEIL1Q96FI4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEIL1Q96FI4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEIL1Q96FI4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEIL1Q96FI4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEIL1Q96FI4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEIL1Q96FI4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEIL1Q96FI4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEIL1Q96FI4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEIL1Q96FI4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEIL1Q96FI4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEIL1Q96FI4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEIL1Q96FI4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEIL1Q96FI4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEIL1Q96FI4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEIL1Q96FI4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NEIL1Q96FI4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEIL1Q96FI4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEIL1Q96FI4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEIL1Q96FI4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NEIL1Q96FI4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEIL1Q96FI4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEIL1Q96FI4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEIL1Q96FI4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NEIL1Q96FI4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEIL1Q96FI4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEIL1Q96FI4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEIL1Q96FI4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEIL1Q96FI4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEIL1Q96FI4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEIL1Q96FI4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEIL1Q96FI4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEIL1Q96FI4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NEIL1Q96FI4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEIL1Q96FI4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEIL1Q96FI4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEIL1Q96FI4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEIL1Q96FI4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEIL1Q96FI4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEIL1Q96FI4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEIL1Q96FI4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NEIL1Q96FI4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEIL1Q96FI4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEIL1Q96FI4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEIL1Q96FI4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEIL1Q96FI4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEIL1Q96FI4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NEIL1Q96FI4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEIL1Q96FI4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NEIL1Q96FI4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEIL1Q96FI4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEIL1Q96FI4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEIL1Q96FI4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEIL1Q96FI4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NEIL1Q96FI4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEIL1Q96FI4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NEIL1Q96FI4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEIL1Q96FI4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEIL1Q96FI4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEIL1Q96FI4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEIL1Q96FI4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEIL1Q96FI4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEIL1Q96FI4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEIL1Q96FI4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEIL1Q96FI4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEIL1Q96FI4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEIL1Q96FI4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEIL1Q96FI4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEIL1Q96FI4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEIL1Q96FI4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEIL1Q96FI4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEIL1Q96FI4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEIL1Q96FI4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEIL1Q96FI4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms