Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP0

RNF31, E3 ubiquitin-protein ligase RNF31, humanhuman

Predictions only

Length 1,072 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF31Q96EP0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF31Q96EP0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF31Q96EP0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF31Q96EP0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF31Q96EP0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RNF31Q96EP0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF31Q96EP0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF31Q96EP0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF31Q96EP0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF31Q96EP0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF31Q96EP0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF31Q96EP0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF31Q96EP0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RNF31Q96EP0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RNF31Q96EP0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF31Q96EP0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF31Q96EP0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF31Q96EP0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF31Q96EP0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF31Q96EP0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF31Q96EP0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF31Q96EP0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF31Q96EP0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF31Q96EP0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF31Q96EP0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF31Q96EP0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF31Q96EP0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF31Q96EP0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF31Q96EP0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF31Q96EP0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF31Q96EP0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF31Q96EP0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF31Q96EP0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF31Q96EP0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF31Q96EP0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF31Q96EP0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF31Q96EP0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF31Q96EP0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF31Q96EP0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF31Q96EP0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF31Q96EP0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF31Q96EP0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF31Q96EP0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF31Q96EP0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNF31Q96EP0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF31Q96EP0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF31Q96EP0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF31Q96EP0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF31Q96EP0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF31Q96EP0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF31Q96EP0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RNF31Q96EP0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF31Q96EP0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF31Q96EP0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF31Q96EP0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF31Q96EP0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF31Q96EP0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF31Q96EP0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF31Q96EP0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF31Q96EP0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF31Q96EP0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF31Q96EP0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF31Q96EP0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF31Q96EP0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF31Q96EP0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF31Q96EP0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF31Q96EP0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF31Q96EP0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF31Q96EP0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF31Q96EP0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF31Q96EP0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF31Q96EP0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF31Q96EP0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF31Q96EP0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF31Q96EP0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF31Q96EP0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF31Q96EP0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF31Q96EP0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF31Q96EP0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RNF31Q96EP0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RNF31Q96EP0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RNF31Q96EP0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF31Q96EP0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF31Q96EP0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF31Q96EP0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF31Q96EP0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF31Q96EP0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF31Q96EP0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF31Q96EP0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF31Q96EP0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF31Q96EP0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF31Q96EP0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF31Q96EP0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF31Q96EP0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF31Q96EP0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF31Q96EP0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF31Q96EP0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF31Q96EP0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF31Q96EP0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF31Q96EP0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms