Protein–RNA interactions for Protein: Q96E40

SPACA9, Sperm acrosome-associated protein 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA9Q96E40 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPACA9Q96E40 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SPACA9Q96E40 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPACA9Q96E40 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SPACA9Q96E40 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPACA9Q96E40 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPACA9Q96E40 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPACA9Q96E40 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPACA9Q96E40 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPACA9Q96E40 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPACA9Q96E40 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPACA9Q96E40 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPACA9Q96E40 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPACA9Q96E40 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPACA9Q96E40 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPACA9Q96E40 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPACA9Q96E40 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPACA9Q96E40 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPACA9Q96E40 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPACA9Q96E40 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SPACA9Q96E40 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPACA9Q96E40 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPACA9Q96E40 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPACA9Q96E40 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPACA9Q96E40 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPACA9Q96E40 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPACA9Q96E40 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPACA9Q96E40 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPACA9Q96E40 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPACA9Q96E40 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPACA9Q96E40 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPACA9Q96E40 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPACA9Q96E40 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SPACA9Q96E40 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPACA9Q96E40 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPACA9Q96E40 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPACA9Q96E40 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SPACA9Q96E40 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPACA9Q96E40 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPACA9Q96E40 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPACA9Q96E40 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPACA9Q96E40 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPACA9Q96E40 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPACA9Q96E40 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPACA9Q96E40 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SPACA9Q96E40 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPACA9Q96E40 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPACA9Q96E40 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPACA9Q96E40 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPACA9Q96E40 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPACA9Q96E40 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPACA9Q96E40 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPACA9Q96E40 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SPACA9Q96E40 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SPACA9Q96E40 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPACA9Q96E40 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPACA9Q96E40 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPACA9Q96E40 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPACA9Q96E40 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SPACA9Q96E40 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPACA9Q96E40 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPACA9Q96E40 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPACA9Q96E40 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPACA9Q96E40 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPACA9Q96E40 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPACA9Q96E40 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPACA9Q96E40 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPACA9Q96E40 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPACA9Q96E40 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPACA9Q96E40 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPACA9Q96E40 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SPACA9Q96E40 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPACA9Q96E40 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPACA9Q96E40 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPACA9Q96E40 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPACA9Q96E40 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPACA9Q96E40 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPACA9Q96E40 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPACA9Q96E40 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPACA9Q96E40 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPACA9Q96E40 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPACA9Q96E40 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPACA9Q96E40 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPACA9Q96E40 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPACA9Q96E40 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPACA9Q96E40 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPACA9Q96E40 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPACA9Q96E40 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPACA9Q96E40 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPACA9Q96E40 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPACA9Q96E40 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPACA9Q96E40 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SPACA9Q96E40 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SPACA9Q96E40 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPACA9Q96E40 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPACA9Q96E40 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPACA9Q96E40 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPACA9Q96E40 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPACA9Q96E40 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPACA9Q96E40 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms