Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC7

TMCO6, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO6Q96DC7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMCO6Q96DC7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMCO6Q96DC7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMCO6Q96DC7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMCO6Q96DC7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TMCO6Q96DC7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMCO6Q96DC7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMCO6Q96DC7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMCO6Q96DC7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TMCO6Q96DC7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMCO6Q96DC7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMCO6Q96DC7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMCO6Q96DC7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMCO6Q96DC7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMCO6Q96DC7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMCO6Q96DC7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMCO6Q96DC7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMCO6Q96DC7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMCO6Q96DC7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMCO6Q96DC7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMCO6Q96DC7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMCO6Q96DC7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMCO6Q96DC7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMCO6Q96DC7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMCO6Q96DC7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMCO6Q96DC7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TMCO6Q96DC7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMCO6Q96DC7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMCO6Q96DC7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMCO6Q96DC7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMCO6Q96DC7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMCO6Q96DC7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMCO6Q96DC7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TMCO6Q96DC7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMCO6Q96DC7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMCO6Q96DC7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMCO6Q96DC7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMCO6Q96DC7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMCO6Q96DC7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMCO6Q96DC7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMCO6Q96DC7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMCO6Q96DC7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMCO6Q96DC7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMCO6Q96DC7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMCO6Q96DC7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMCO6Q96DC7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMCO6Q96DC7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMCO6Q96DC7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMCO6Q96DC7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMCO6Q96DC7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMCO6Q96DC7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMCO6Q96DC7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMCO6Q96DC7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMCO6Q96DC7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TMCO6Q96DC7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMCO6Q96DC7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMCO6Q96DC7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMCO6Q96DC7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMCO6Q96DC7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMCO6Q96DC7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TMCO6Q96DC7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMCO6Q96DC7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMCO6Q96DC7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TMCO6Q96DC7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMCO6Q96DC7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMCO6Q96DC7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMCO6Q96DC7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMCO6Q96DC7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMCO6Q96DC7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMCO6Q96DC7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMCO6Q96DC7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMCO6Q96DC7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMCO6Q96DC7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMCO6Q96DC7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMCO6Q96DC7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMCO6Q96DC7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMCO6Q96DC7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMCO6Q96DC7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMCO6Q96DC7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMCO6Q96DC7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMCO6Q96DC7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMCO6Q96DC7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMCO6Q96DC7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMCO6Q96DC7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMCO6Q96DC7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMCO6Q96DC7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMCO6Q96DC7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMCO6Q96DC7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TMCO6Q96DC7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMCO6Q96DC7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMCO6Q96DC7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMCO6Q96DC7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMCO6Q96DC7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMCO6Q96DC7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMCO6Q96DC7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMCO6Q96DC7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMCO6Q96DC7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMCO6Q96DC7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMCO6Q96DC7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMCO6Q96DC7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 241.3 ms