Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ5

CCDC127, Coiled-coil domain-containing protein 127, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC127Q96BQ5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC127Q96BQ5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC127Q96BQ5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC127Q96BQ5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC127Q96BQ5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC127Q96BQ5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC127Q96BQ5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC127Q96BQ5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC127Q96BQ5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC127Q96BQ5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC127Q96BQ5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC127Q96BQ5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC127Q96BQ5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC127Q96BQ5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC127Q96BQ5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC127Q96BQ5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC127Q96BQ5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC127Q96BQ5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC127Q96BQ5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC127Q96BQ5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC127Q96BQ5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC127Q96BQ5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC127Q96BQ5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC127Q96BQ5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC127Q96BQ5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC127Q96BQ5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC127Q96BQ5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC127Q96BQ5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC127Q96BQ5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC127Q96BQ5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC127Q96BQ5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC127Q96BQ5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC127Q96BQ5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC127Q96BQ5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC127Q96BQ5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC127Q96BQ5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC127Q96BQ5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC127Q96BQ5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC127Q96BQ5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC127Q96BQ5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC127Q96BQ5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC127Q96BQ5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC127Q96BQ5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC127Q96BQ5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC127Q96BQ5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC127Q96BQ5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC127Q96BQ5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC127Q96BQ5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC127Q96BQ5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC127Q96BQ5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC127Q96BQ5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC127Q96BQ5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC127Q96BQ5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC127Q96BQ5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
CCDC127Q96BQ5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC127Q96BQ5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC127Q96BQ5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC127Q96BQ5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC127Q96BQ5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC127Q96BQ5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC127Q96BQ5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC127Q96BQ5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC127Q96BQ5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC127Q96BQ5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC127Q96BQ5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC127Q96BQ5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC127Q96BQ5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC127Q96BQ5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC127Q96BQ5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC127Q96BQ5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC127Q96BQ5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC127Q96BQ5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC127Q96BQ5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC127Q96BQ5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC127Q96BQ5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC127Q96BQ5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC127Q96BQ5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC127Q96BQ5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC127Q96BQ5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC127Q96BQ5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC127Q96BQ5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC127Q96BQ5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC127Q96BQ5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC127Q96BQ5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC127Q96BQ5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC127Q96BQ5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC127Q96BQ5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC127Q96BQ5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC127Q96BQ5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC127Q96BQ5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC127Q96BQ5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC127Q96BQ5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC127Q96BQ5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC127Q96BQ5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC127Q96BQ5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC127Q96BQ5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC127Q96BQ5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC127Q96BQ5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC127Q96BQ5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC127Q96BQ5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms