Protein–RNA interactions for Protein: Q96AE7

TTC17, Tetratricopeptide repeat protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC17Q96AE7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTC17Q96AE7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTC17Q96AE7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTC17Q96AE7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
TTC17Q96AE7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TTC17Q96AE7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC17Q96AE7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTC17Q96AE7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTC17Q96AE7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTC17Q96AE7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTC17Q96AE7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTC17Q96AE7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTC17Q96AE7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TTC17Q96AE7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTC17Q96AE7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTC17Q96AE7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTC17Q96AE7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTC17Q96AE7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTC17Q96AE7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTC17Q96AE7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTC17Q96AE7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTC17Q96AE7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTC17Q96AE7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTC17Q96AE7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTC17Q96AE7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTC17Q96AE7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTC17Q96AE7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTC17Q96AE7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTC17Q96AE7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTC17Q96AE7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTC17Q96AE7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTC17Q96AE7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTC17Q96AE7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTC17Q96AE7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTC17Q96AE7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TTC17Q96AE7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TTC17Q96AE7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TTC17Q96AE7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TTC17Q96AE7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TTC17Q96AE7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TTC17Q96AE7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTC17Q96AE7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTC17Q96AE7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTC17Q96AE7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTC17Q96AE7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TTC17Q96AE7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTC17Q96AE7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTC17Q96AE7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TTC17Q96AE7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TTC17Q96AE7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC17Q96AE7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TTC17Q96AE7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TTC17Q96AE7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TTC17Q96AE7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TTC17Q96AE7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TTC17Q96AE7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TTC17Q96AE7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TTC17Q96AE7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TTC17Q96AE7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TTC17Q96AE7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TTC17Q96AE7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TTC17Q96AE7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TTC17Q96AE7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TTC17Q96AE7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TTC17Q96AE7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TTC17Q96AE7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TTC17Q96AE7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TTC17Q96AE7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TTC17Q96AE7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TTC17Q96AE7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTC17Q96AE7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTC17Q96AE7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTC17Q96AE7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TTC17Q96AE7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TTC17Q96AE7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TTC17Q96AE7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TTC17Q96AE7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TTC17Q96AE7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TTC17Q96AE7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TTC17Q96AE7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTC17Q96AE7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTC17Q96AE7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTC17Q96AE7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTC17Q96AE7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTC17Q96AE7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTC17Q96AE7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TTC17Q96AE7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTC17Q96AE7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTC17Q96AE7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TTC17Q96AE7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTC17Q96AE7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTC17Q96AE7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTC17Q96AE7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTC17Q96AE7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TTC17Q96AE7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TTC17Q96AE7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TTC17Q96AE7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TTC17Q96AE7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TTC17Q96AE7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTC17Q96AE7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms