Protein–RNA interactions for Protein: Q969M3

YIPF5, Protein YIPF5, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF5Q969M3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
YIPF5Q969M3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
YIPF5Q969M3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YIPF5Q969M3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YIPF5Q969M3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YIPF5Q969M3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YIPF5Q969M3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YIPF5Q969M3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YIPF5Q969M3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
YIPF5Q969M3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
YIPF5Q969M3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
YIPF5Q969M3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
YIPF5Q969M3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
YIPF5Q969M3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
YIPF5Q969M3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
YIPF5Q969M3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
YIPF5Q969M3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
YIPF5Q969M3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
YIPF5Q969M3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
YIPF5Q969M3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
YIPF5Q969M3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
YIPF5Q969M3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
YIPF5Q969M3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
YIPF5Q969M3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
YIPF5Q969M3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
YIPF5Q969M3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
YIPF5Q969M3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
YIPF5Q969M3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
YIPF5Q969M3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
YIPF5Q969M3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
YIPF5Q969M3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
YIPF5Q969M3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
YIPF5Q969M3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
YIPF5Q969M3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
YIPF5Q969M3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
YIPF5Q969M3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
YIPF5Q969M3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
YIPF5Q969M3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
YIPF5Q969M3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
YIPF5Q969M3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
YIPF5Q969M3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
YIPF5Q969M3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
YIPF5Q969M3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
YIPF5Q969M3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
YIPF5Q969M3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
YIPF5Q969M3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
YIPF5Q969M3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
YIPF5Q969M3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
YIPF5Q969M3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
YIPF5Q969M3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
YIPF5Q969M3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
YIPF5Q969M3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
YIPF5Q969M3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
YIPF5Q969M3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
YIPF5Q969M3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YIPF5Q969M3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
YIPF5Q969M3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
YIPF5Q969M3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
YIPF5Q969M3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
YIPF5Q969M3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YIPF5Q969M3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YIPF5Q969M3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
YIPF5Q969M3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
YIPF5Q969M3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
YIPF5Q969M3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
YIPF5Q969M3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
YIPF5Q969M3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
YIPF5Q969M3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YIPF5Q969M3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
YIPF5Q969M3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
YIPF5Q969M3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
YIPF5Q969M3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
YIPF5Q969M3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YIPF5Q969M3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
YIPF5Q969M3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YIPF5Q969M3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YIPF5Q969M3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YIPF5Q969M3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
YIPF5Q969M3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
YIPF5Q969M3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
YIPF5Q969M3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
YIPF5Q969M3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YIPF5Q969M3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YIPF5Q969M3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
YIPF5Q969M3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
YIPF5Q969M3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
YIPF5Q969M3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
YIPF5Q969M3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
YIPF5Q969M3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
YIPF5Q969M3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YIPF5Q969M3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YIPF5Q969M3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YIPF5Q969M3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YIPF5Q969M3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YIPF5Q969M3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YIPF5Q969M3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YIPF5Q969M3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YIPF5Q969M3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YIPF5Q969M3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YIPF5Q969M3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms