Protein–RNA interactions for Protein: Q92543

SNX19, Sorting nexin-19, humanhuman

Predictions only

Length 992 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX19Q92543 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNX19Q92543 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SNX19Q92543 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNX19Q92543 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNX19Q92543 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNX19Q92543 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNX19Q92543 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNX19Q92543 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNX19Q92543 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNX19Q92543 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX19Q92543 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX19Q92543 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX19Q92543 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNX19Q92543 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SNX19Q92543 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNX19Q92543 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNX19Q92543 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SNX19Q92543 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNX19Q92543 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNX19Q92543 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNX19Q92543 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNX19Q92543 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNX19Q92543 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNX19Q92543 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SNX19Q92543 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNX19Q92543 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNX19Q92543 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNX19Q92543 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNX19Q92543 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNX19Q92543 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNX19Q92543 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX19Q92543 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX19Q92543 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX19Q92543 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNX19Q92543 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNX19Q92543 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNX19Q92543 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SNX19Q92543 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SNX19Q92543 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNX19Q92543 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNX19Q92543 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX19Q92543 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX19Q92543 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNX19Q92543 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNX19Q92543 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNX19Q92543 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNX19Q92543 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNX19Q92543 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNX19Q92543 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNX19Q92543 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNX19Q92543 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNX19Q92543 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SNX19Q92543 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNX19Q92543 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX19Q92543 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX19Q92543 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX19Q92543 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX19Q92543 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX19Q92543 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX19Q92543 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNX19Q92543 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNX19Q92543 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNX19Q92543 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNX19Q92543 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX19Q92543 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX19Q92543 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX19Q92543 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX19Q92543 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX19Q92543 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX19Q92543 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX19Q92543 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNX19Q92543 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX19Q92543 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX19Q92543 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNX19Q92543 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SNX19Q92543 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNX19Q92543 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNX19Q92543 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX19Q92543 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNX19Q92543 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNX19Q92543 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNX19Q92543 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SNX19Q92543 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNX19Q92543 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX19Q92543 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX19Q92543 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX19Q92543 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX19Q92543 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX19Q92543 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX19Q92543 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNX19Q92543 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNX19Q92543 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNX19Q92543 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNX19Q92543 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNX19Q92543 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNX19Q92543 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNX19Q92543 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNX19Q92543 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNX19Q92543 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNX19Q92543 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms