Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWL7

CCNB3, G2/mitotic-specific cyclin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 1,395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB3Q8WWL7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.41■■■■■ 4.38
CCNB3Q8WWL7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC42.4■■■■■ 4.38
CCNB3Q8WWL7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
CCNB3Q8WWL7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
CCNB3Q8WWL7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC42.39■■■■■ 4.38
CCNB3Q8WWL7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC42.39■■■■■ 4.38
CCNB3Q8WWL7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
CCNB3Q8WWL7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
CCNB3Q8WWL7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC42.37■■■■■ 4.37
CCNB3Q8WWL7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
CCNB3Q8WWL7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
CCNB3Q8WWL7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
CCNB3Q8WWL7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
CCNB3Q8WWL7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
CCNB3Q8WWL7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
CCNB3Q8WWL7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.29■■■■■ 4.36
CCNB3Q8WWL7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
CCNB3Q8WWL7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC42.28■■■■■ 4.36
CCNB3Q8WWL7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC42.28■■■■■ 4.36
CCNB3Q8WWL7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
CCNB3Q8WWL7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.36
CCNB3Q8WWL7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
CCNB3Q8WWL7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC42.26■■■■■ 4.35
CCNB3Q8WWL7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
CCNB3Q8WWL7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
CCNB3Q8WWL7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC42.21■■■■■ 4.35
CCNB3Q8WWL7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC42.21■■■■■ 4.35
CCNB3Q8WWL7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC42.21■■■■■ 4.35
CCNB3Q8WWL7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
CCNB3Q8WWL7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
CCNB3Q8WWL7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
CCNB3Q8WWL7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
CCNB3Q8WWL7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
CCNB3Q8WWL7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
CCNB3Q8WWL7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
CCNB3Q8WWL7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC42.14■■■■■ 4.34
CCNB3Q8WWL7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.13■■■■■ 4.33
CCNB3Q8WWL7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
CCNB3Q8WWL7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
CCNB3Q8WWL7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
CCNB3Q8WWL7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
CCNB3Q8WWL7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
CCNB3Q8WWL7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.07■■■■■ 4.33
CCNB3Q8WWL7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.07■■■■■ 4.33
CCNB3Q8WWL7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
CCNB3Q8WWL7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
CCNB3Q8WWL7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC42.05■■■■■ 4.32
CCNB3Q8WWL7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC42.04■■■■■ 4.32
CCNB3Q8WWL7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
CCNB3Q8WWL7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC42.03■■■■■ 4.32
CCNB3Q8WWL7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
CCNB3Q8WWL7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC42.02■■■■■ 4.32
CCNB3Q8WWL7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
CCNB3Q8WWL7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.31
CCNB3Q8WWL7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
CCNB3Q8WWL7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
CCNB3Q8WWL7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
CCNB3Q8WWL7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
CCNB3Q8WWL7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC41.98■■■■■ 4.31
CCNB3Q8WWL7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC41.98■■■■■ 4.31
CCNB3Q8WWL7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC41.97■■■■■ 4.31
CCNB3Q8WWL7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC41.97■■■■■ 4.31
CCNB3Q8WWL7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
CCNB3Q8WWL7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.95■■■■■ 4.31
CCNB3Q8WWL7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
CCNB3Q8WWL7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
CCNB3Q8WWL7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
CCNB3Q8WWL7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC41.94■■■■■ 4.3
CCNB3Q8WWL7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC41.94■■■■■ 4.3
CCNB3Q8WWL7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
CCNB3Q8WWL7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
CCNB3Q8WWL7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
CCNB3Q8WWL7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
CCNB3Q8WWL7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
CCNB3Q8WWL7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
CCNB3Q8WWL7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
CCNB3Q8WWL7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC41.89■■■■■ 4.3
CCNB3Q8WWL7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
CCNB3Q8WWL7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
CCNB3Q8WWL7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC41.86■■■■■ 4.29
CCNB3Q8WWL7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC41.85■■■■■ 4.29
CCNB3Q8WWL7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
CCNB3Q8WWL7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
CCNB3Q8WWL7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
CCNB3Q8WWL7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
CCNB3Q8WWL7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
CCNB3Q8WWL7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC41.81■■■■■ 4.28
CCNB3Q8WWL7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
CCNB3Q8WWL7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC41.8■■■■■ 4.28
CCNB3Q8WWL7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC41.8■■■■■ 4.28
CCNB3Q8WWL7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC41.8■■■■■ 4.28
CCNB3Q8WWL7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
CCNB3Q8WWL7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
CCNB3Q8WWL7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
CCNB3Q8WWL7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
CCNB3Q8WWL7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC41.75■■■■■ 4.27
CCNB3Q8WWL7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
CCNB3Q8WWL7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC41.75■■■■■ 4.27
CCNB3Q8WWL7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC41.74■■■■■ 4.27
CCNB3Q8WWL7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms