Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI0

CHD5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD5Q8TDI0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHD5Q8TDI0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHD5Q8TDI0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CHD5Q8TDI0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHD5Q8TDI0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHD5Q8TDI0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHD5Q8TDI0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHD5Q8TDI0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHD5Q8TDI0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHD5Q8TDI0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHD5Q8TDI0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHD5Q8TDI0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHD5Q8TDI0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHD5Q8TDI0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHD5Q8TDI0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHD5Q8TDI0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHD5Q8TDI0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CHD5Q8TDI0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHD5Q8TDI0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHD5Q8TDI0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHD5Q8TDI0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHD5Q8TDI0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHD5Q8TDI0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHD5Q8TDI0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHD5Q8TDI0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHD5Q8TDI0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHD5Q8TDI0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHD5Q8TDI0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHD5Q8TDI0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHD5Q8TDI0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHD5Q8TDI0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHD5Q8TDI0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHD5Q8TDI0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHD5Q8TDI0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHD5Q8TDI0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHD5Q8TDI0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHD5Q8TDI0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHD5Q8TDI0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHD5Q8TDI0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHD5Q8TDI0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHD5Q8TDI0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHD5Q8TDI0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
CHD5Q8TDI0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHD5Q8TDI0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHD5Q8TDI0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHD5Q8TDI0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHD5Q8TDI0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHD5Q8TDI0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CHD5Q8TDI0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHD5Q8TDI0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CHD5Q8TDI0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHD5Q8TDI0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHD5Q8TDI0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHD5Q8TDI0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHD5Q8TDI0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHD5Q8TDI0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CHD5Q8TDI0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHD5Q8TDI0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHD5Q8TDI0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CHD5Q8TDI0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHD5Q8TDI0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHD5Q8TDI0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHD5Q8TDI0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHD5Q8TDI0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHD5Q8TDI0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHD5Q8TDI0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHD5Q8TDI0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHD5Q8TDI0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHD5Q8TDI0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHD5Q8TDI0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHD5Q8TDI0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHD5Q8TDI0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CHD5Q8TDI0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CHD5Q8TDI0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHD5Q8TDI0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHD5Q8TDI0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHD5Q8TDI0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHD5Q8TDI0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHD5Q8TDI0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHD5Q8TDI0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CHD5Q8TDI0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHD5Q8TDI0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHD5Q8TDI0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHD5Q8TDI0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHD5Q8TDI0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHD5Q8TDI0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CHD5Q8TDI0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHD5Q8TDI0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHD5Q8TDI0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHD5Q8TDI0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHD5Q8TDI0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHD5Q8TDI0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHD5Q8TDI0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHD5Q8TDI0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHD5Q8TDI0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHD5Q8TDI0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHD5Q8TDI0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHD5Q8TDI0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHD5Q8TDI0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHD5Q8TDI0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms